丝氨酸蛋白酶抑制剂的发展显示一个多中心短(< 2.3)氢键绑定模式:抑制剂urokinase-type Xa纤溶酶原激活物和因素。

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小弗纳E, Katz英航,斯宾塞,艾伦D, Hataye J, Hruzewicz W,回族HC, Kolesnikov A, Y,陈德良C,马特利,Radika K, Rai R,她M,他还W, Sprengeler PA,特拉普,王J,年轻的白平衡,Mackman RL

丝氨酸蛋白酶抑制剂的发展显示一个多中心短(< 2.3)氢键绑定模式:抑制剂urokinase-type Xa纤溶酶原激活物和因素。

J地中海化学。2001年8月16日,44 (17):2753 - 71。

PubMed ID

11495587 (在PubMed

]

文摘

小说支架结合丝氨酸蛋白酶通过一个独特的网络短氢键的催化Ser195已经开发出来。由此产生的丝氨酸蛋白酶抑制剂的设计从铅分子2 - (2-hydroxyphenyl) 1 h-benzoimidazole-5-carboxamidine, 6 b,这是显示多个绑定模式。例如,6 b可以招募锌和绑定的方式类似于报道bis (5-amidino-2-benzimidazolyl)甲烷(BABIM)(自然1998,391,608 - 612)。(1)另外,6 b可以绑定在缺乏锌通过多中心网络的短(< 2.3)氢键。zinc-independent绑定模式的领导结构优化对一个6人小组丝氨酸蛋白酶产量优化抑制剂如2 - 1 h-indole-5-carboxamidine (3-bromo-2-hydroxy-5-methylphenyl), 22岁,和2 - (2-hydroxybiphenyl-3-yl) 1 h-indole-5-carboxamidine 22 f。结构活性关系的确定,除了脒函数,吲哚、苯并咪唑和邻位的取代酚组也最佳效能的关键组件。的亲和力(K (i)) 22日和22 f,例如,轴承这些群体范围从8到600海里向一组六人的丝氨酸蛋白酶。高分辨率的晶体结构表明,这些分子的绑定模式的一些酶是相同的,所涉及的6 b和短(< 2.3)抑制剂羟基之间的氢键氧气,Ser195,和一个水分子被困在oxyanion洞。在求和、小说和强有力的trypsin-like丝氨酸蛋白酶抑制剂具有一个独特的方式绑定被发现。

DrugBank数据引用了这篇文章

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
2 -{二羟基-[1,1 '联苯]3-yl} 1 h, 3-benzodiazole-5-carboximidamide	凝血酶原	Ki (nM)	15000年	N /一个	N /一个	细节
2 -{二羟基-[1,1 '联苯]3-yl} 1 h, 3-benzodiazole-5-carboximidamide	Trypsin-1	Ki (nM)	6500年	N /一个	N /一个	细节
2 -{二羟基-[1,1 '联苯]3-yl} 1 h, 3-benzodiazole-5-carboximidamide	Urokinase-type纤溶酶原激活物	Ki (nM)	400年	N /一个	N /一个	细节