通过x射线晶体学筛选鉴定n -苯基酞酰亚胺抑制细菌胸腺酸合成酶的结合方式。

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曼加尼S, Cancian L, Leone R, Pozzi C, Lazzari S, Luciani R, Ferrari S, Costi MP

通过x射线晶体学筛选鉴定n -苯基酞酰亚胺抑制细菌胸腺酸合成酶的结合方式。

中华医学化学杂志2011年8月11日;54(15):5454-67。doi: 10.1021 / jm2005018。Epub 2011年7月12日。

PubMed ID

21696158 (PubMed视图

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摘要

为了鉴定特定的细菌胸苷合成酶(TS)抑制剂，我们利用了酚酞(PTH)，它可以抑制细菌和人类的酶。结合甲状旁腺激素的干酪乳杆菌TS (LcTS)的x射线晶体结构显示了该抑制剂的多种结合模式，这阻碍了经典的基于结构的药物设计方法。为了克服这个问题，我们合成了两个邻苯二甲酸酯文库，并对TS酶进行了测试，然后对活性化合物进行了x射线晶体学筛选。化合物6A、8A和12A对细菌TS的亲和力比人TS高40倍。x射线晶体学筛选确定了6种抑制剂与LcTS的结合模式。其中，20A、23A和24A显示了共同的唯一绑定模式，而8A显示了不同的唯一绑定模式。与致病性TS获得的LcTS x射线配合物进行比较分析，可以选择化合物8A和23A作为特异性化合物，并作为开发特异性抑制致病性酶的起点。

引用本文的药物库数据

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
(2) - 2-chloropyridin-4-yl 4-methyl-1h-isoindole-1 3 (2 h)土卫四	Thymidylate合酶	Ki (nM)	23000	N/A	N/A	细节
4 - (4-methyl-1 3-dioxo-1 3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)苄腈	Thymidylate合酶	Ki (nM)	22000	N/A	N/A	细节