“虚拟片段链接”:一个方法来识别有效的绑定从低亲和力碎片击中。

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Crisman TJ,本德,Milik M,詹金斯杰,任由J, Sukuru SC, Fejzo J,鞍环U,戴维斯JW,格里克M

“虚拟片段链接”:一个方法来识别有效的绑定从低亲和力碎片击中。

J地中海化学。2008年4月24日,51 (8):2481 - 91。doi: 10.1021 / jm701314u。Epub 2008年3月22日。

PubMed ID

18357974 (在PubMed

]

文摘

在这个工作我们探索的可能性使用fragment-based筛选数据优先从完整的高温超导化合物库,一个方法我们称之为虚拟片段连接(VFL)。VFL确定化合物的能力基于微摩尔的片段的摩尔效力绑定数据测试75目标类袋熊数据库和成功的57例。此外,七药物靶点的方法演示了从内部筛选程序,执行8800年的边后卫碎片和屏幕的图书馆。VFL捕获在28%和67%之间的支安打(IC 50 < 10 microm)排名在前5%的图书馆的四个目标(浓缩5倍和13之间)。我们的研究结果使我们得出这样的结论:适当的覆盖率的化学空间片段库VFL方法成功的关键在优先考虑高温超导图书馆从fragment-based筛选数据。

DrugBank数据引用了这篇文章

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
(2)- 5-HYDROXY-NAPHTHALEN-1-YL 3-BENZOOXAZOL-6-OL	雌激素受体β	集成电路50 (nM)	5	N /一个	N /一个	细节
(3)- 6-HYDROXY-NAPHTHALEN-2-YL苯并[D] ISOOXAZOL-6-OL	雌激素受体β	集成电路50 (nM)	1	N /一个	N /一个	细节