人因子Xa与有效抑制剂络合的晶体结构。

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Maignan S, Guilloteau JP, Pouzieux S, Choi-Sledeski YM, Becker MR, Klein SI, Ewing WR, Pauls HW, Spada AP, Mikol V

人因子Xa与有效抑制剂络合的晶体结构。

中华医学化学杂志2000 8月24日;43(17):3226-32。

PubMed ID

10966741 (PubMed视图

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摘要

参与凝血级联的因子Xa (FXa)是一种丝氨酸蛋白酶，作为开发新型抗血栓药物的潜在靶点而引起了人们的极大兴趣。虽然关于凝血酶配合物的结构数据非常丰富，但配体/FXa配合物的结构很少被报道，可能是因为晶体生长困难。已发现人体des-Gla1-45混凝FXa的可复制结晶条件。与之前报道的晶体(2.3-2.8 A)相比，这导致了晶体衍射质量的改善(约2.1 A)，从而为基于结构的药物设计方法提供了合适的平台。确定了一系列与FXa络合的非共价抑制剂的晶体结构，本文介绍了其中的三种。这些化合物包括含有苯甲脒部分的化合物和碱基的替代物。含有苯甲脒的化合物以典型的合成丝氨酸蛋白酶抑制剂的典型方式结合。相反，含有苯甲脒基替代品的分子不会与S1口袋底部的Asp189羧酸盐发生直接的氢键相互作用。这些结构数据为这些抑制剂的特异性提供了可能的解释，并为设计生物可利用的强效FXa抑制剂提供了很大的帮助。

引用本文的药物库数据

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
Thieno [3,2- b]吡啶-2-磺酸[1-(1-氨基-异喹啉-7-基甲基)-2-氧-吡咯-3-基]-酰胺	凝血因子X	Ki (nM)	22	7．5	22	细节
Thieno [3,2- b]吡啶-2-磺酸[2-氧-1-(1h -吡咯[2,3- c]吡啶-2-基甲基)-吡咯烷-3-基]-酰胺	凝血因子X	Ki (nM)	18	7．5	22	细节