分子建模研究血管内皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂使用构象和对接。

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杜J, Lei B,秦J,刘H,姚明X

分子建模研究血管内皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂使用构象和对接。

J摩尔图模型。2009年1月,27 (5):642 - 54。doi: 10.1016 / j.jmgm.2008.10.006。Epub 2008 11月5。

PubMed ID

19081278 (在PubMed

]

文摘

血管内皮生长因子(VEGF)及其受体酪氨酸激酶VEGFR-2或插入域受体激酶(KDR)是有吸引力的目标发展的新型抗癌药物。在目前的工作,比较分子场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)进行一系列KDR的选择性抑制剂。对接研究之间的绑定模式进行探索所有的抑制剂和KDR产生每个化合物的生物活性构象在整个数据集。两个conformer-based对齐策略被用来构造可靠3 d-qsar模型。停靠conformer-based对齐策略给最好的3 d-qsar模型。最好的CoMFA和CoMSIA模型做了一个旨在系数q(2) 0.546和0.715,non-cross-validated r(2) 0.936和0.961的值,预测r(2)值的0.673和0.797,分别。获得的信息从分子建模研究非常有用的设计一些新颖的选择性抑制剂KDR所需的活动。

DrugBank数据引用了这篇文章

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
7-dimethoxyquinolin-4-yl N-cyclopropyl-6 -[(6日)氧]naphthalene-1-carboxamide	血管内皮生长因子受体2	集成电路50 (nM)	0.603	N /一个	N /一个	细节