CH的重要性/π氢键在理性药物设计:一个从头开始片段分子轨道研究leukocyte-specific蛋白质酪氨酸激酶(LCK)。

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小泽T,信E,小泽米翰达岛C, Mukaiyama H,西村T,小林,冈崎K

CH的重要性/π氢键在理性药物设计:一个从头开始片段分子轨道研究leukocyte-specific蛋白质酪氨酸激酶(LCK)。

Bioorg医疗化学。2008年12月15日,16日(24):10311 - 8。doi: 10.1016 / j.bmc.2008.10.041。Epub 2008年10月22日。

PubMed ID

18977146 (在PubMed

]

文摘

相互作用能的计算,从头开始FMO方法,LCK蛋白质之间的复合物和四个抑制剂(staurosporine, BMS化合物2,化合物3和4)。在任何情况下的CH /π氢键被披露在所谓的腺嘌呤的口袋里。复合物的2、3和4,CH / pi和NH /π氢键曾被观察到在另一个口袋里。鉴于上述结果,3取代2的苯胺环,6-dimethyl苯胺为LCK激酶增加力量。增加10倍的力量已经达到4 / 3。我们建议的概念弱氢键在药物的合理设计是有用的。

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绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
(N) - 2-chlorophenyl 5-phenylimidazo pyrazin-8-amine (1、5)	酪氨酸受体激酶Lck	集成电路50 (nM)	220年	N /一个	N /一个	细节
(N) - 2, 6-dimethylphenyl 5-phenylimidazo pyrazin-8-amine (1、5)	酪氨酸受体激酶Lck	集成电路50 (nM)	20.	N /一个	N /一个	细节