减少caspase-3抑制剂的肽基特征:结构分析。

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贝克尔JW,罗通达J、Soisson SM Aspiotis R, Bayly C, Francoeur年代,勇敢的M, Garcia-Calvo M,吉鲁,格林E,汉族Y,麦凯D,尼科尔森DW,彼得森E, Renaud J,罗伊,瑟隆伯利N, Zamboni R

减少caspase-3抑制剂的肽基特征:结构分析。

J地中海化学。2004年5月6日,47 (10):2466 - 74。

PubMed ID

15115390 (在PubMed

]

文摘

还半胱氨酸蛋白酶,特别是裂开Asp-Xxx债券。他们主要代理在炎症和细胞凋亡和有吸引力的目标治疗炎症、神经退化,缺血,和癌症。许多半胱天冬酶结构是已知的,但大多数涉及肽或蛋白质抑制剂,其貌不扬的候选药物开发。我们现在七个晶体结构的抑制caspase-3说明几种方法减少的肽基特征抑制剂同时保持他们的力量和选择性。抑制剂的抑制剂降低肽基性质,同时保留绑定(1)效力。利用疏水结合位点c端裂解位点,(2)取代带负电荷的天门冬氨酰残留在P4中立的组织,和(3)。使用peptidomimetic 5, 6, 7-tricyclic系统或pyrazinone P2-P3。此外,我们发现两个烟碱酸醛诱导显著构象变化的S2和S3子caspase-3,揭示一个意想不到的绑定模式。这些结果提前寻找caspase-directed药物必威国际app通过揭示不可接受的分子特性可以删除而不失去效力。

DrugBank数据引用了这篇文章

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
4 - (5 - (2-CARBOXY-1-FORMYL-ETHYLCARBAMOYL) -PYRIDIN-3-YL]安息香酸	Caspase-3	集成电路50 (nM)	1735年	7	37	细节