受体的灵活性在硅片筛选试剂的S1 '人类胶原酶的口袋里。

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Kallblad P,托多罗夫NP, Willems嗯,爱

受体的灵活性在硅片筛选试剂的S1 '人类胶原酶的口袋里。

J医学杂志。2004年5月20日,47 (11):2761 - 7。

PubMed ID

15139754 (在PubMed

]

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基于结构的分子设计的主要困难是protein-ligand复杂的结构的预测,因为大量的自由度。通常,目标蛋白质保持严格的在一个低能构象。然而,这并不反映蛋白质结构的动态特性。在这项工作中,我们调查的影响受体的灵活性在虚拟筛选试剂在一个共同的脚手架S1的口袋里的人类胶原酶(矩阵metalloproteinase-1)。我们比较筛选使用单晶结构和多个核磁共振结构,apo和整体形式。我们也调查的两种计算方法解决受体的灵活性时,可以使用核磁共振数据不可用。虚拟筛选的结果使用获得的实验结构相比使用这两种计算方法。从结果,我们得出结论关于目标的灵活性的影响积极的识别和不同试剂在虚拟筛选的协议。

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绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
[[1 - [N-HYDROXY-ACETAMIDYL] 3-methyl-butyl] -CARBONYL-LEUCINYL]丙氨酸乙酯	间质胶原酶	集成电路50 (nM)	40	N /一个	N /一个	细节