影响的混杂Pim-1激酶抑制剂片段fragment-based药物设计的疏水相互作用。

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好交流,刘J, Hirth B, Asmussen G,湘Y, Biemann惠普,主教KA, Fremgen T,菲茨杰拉德M T -格拉迪斯史娃,耆那教,Jancsics K,梅斯M, Papoulis, Skerlj R, Stepp JD,魏RR

影响的混杂Pim-1激酶抑制剂片段fragment-based药物设计的疏水相互作用。

J医学杂志。2012年3月22日,55岁(6):2641 - 8。doi: 10.1021 / jm2014698。Epub 2012 3月5。

PubMed ID

22339127 (在PubMed

]

文摘

我们研究了分段对接的微妙之处和绑定在Pim-1激酶抑制剂使用生成的数据计划。晶体和对接已开展数据分析使用抑制剂复合物来源于内部表面等离子体共振(SPR)片段屏幕,屏幕虚拟针,和一个新创片段抑制剂混合设计。这些调查强调片段不填满他们的绑定的口袋可以展览滥交的疏水相互作用由于缺乏空间的限制强加在他们头上的边界表示的口袋里。因此,对接模式,不同意一个观察晶体结构,但保持关键结晶学观察氢键仍有潜在价值的配体的设计和优化。这一观点相悖的传说fragment-based药物设计,所有片段精化必须基于父独自晶体结构。

DrugBank数据引用了这篇文章

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
2,3-diphenyl-1H-indole-7-carboxylic酸	丝氨酸/ threonine-protein激酶pim-1	集成电路50 (nM)	550年	N /一个	N /一个	细节