映射的第二四环素在核糖体结合位点小亚基的大肠杆菌。

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Anokhina MM, Barta A Nierhaus KH Spiridonova VA, Kopylov

映射的第二四环素在核糖体结合位点小亚基的大肠杆菌。

核酸研究》2004年5月11日,32 (8):2594 - 7。doi: 10.1093 / nar / gkh583。打印2004。

PubMed ID

15141029 (在PubMed

]

文摘

四环素块稳定的氨酰绑定到细菌核糖体的网站。各种四环素结合位点已确定晶体的30 s核糖体亚基小栖热菌属酸奶。在这里,我们描述一个直接的照片——核糖体的亲和力修改小亚基的大肠杆菌7 - [3 h]四环素。选择特定的相互作用,过量的30年代在四环素已经使用子单元。引物延伸分析16 s rRNA透露两个网站的修改:C936 C948。考虑可用数据四环素与原核30年代亚基的相互作用,包括了数据(大肠杆菌),(T.thermophilus)和遗传数据的x射线数据(幽门螺旋杆菌,大肠杆菌),第二个四环素高亲和力结合位点是提出在3 '——主要领域的16 s rRNA,除了四环素绑定网站相关的网站。

DrugBank数据引用了这篇文章

药物靶点

药物	目标	类	生物	药理作用	行动
Omadacycline	16 s rrna	核苷酸	肠道细菌和其他真细菌	是的	抑制剂	细节
Omadacycline	30年代核糖体蛋白S14系列	蛋白质	大肠杆菌(应变K12)	是的	抑制剂	细节
Omadacycline	30年代S19核糖体蛋白质	蛋白质	大肠杆菌(应变K12)	是的	抑制剂	细节
Omadacycline	30年代核糖体蛋白S3	蛋白质	大肠杆菌(应变K12)	是的	抑制剂	细节
Omadacycline	30年代S7核糖体蛋白质	蛋白质	大肠杆菌(应变K12)	是的	抑制剂	细节
Omadacycline	30年代S8核糖体蛋白质	蛋白质	大肠杆菌(应变K12)	是的	抑制剂	细节