德国cDNA财团的full-ORF克隆资源。

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贝克特尔年代,罗森菲尔德H,杜达,施密特CP,恩斯特U, Wellenreuther R, Mehrle,舒斯特尔C,巴尔,拦截器H, Heubner D, Hoerlein,米歇尔•G Wedler H, Kohrer K, Ottenwalder B, Poustka, Wiemann年代,思楚普我

德国cDNA财团的full-ORF克隆资源。

BMC基因组学。2007年10月31日,8:399。

PubMed ID

17974005 (在PubMed

]

文摘

背景:随着人类基因组序列的完成编码蛋白的功能分析和表征已经成为下一个敦促后基因组时代的挑战。缺乏全面ORFeome资源目前阻碍蛋白质功能分析系统的应用程序。基因和ORF覆盖全身的ORF克隆因此需要扩展。结合一个独特的和通用的克隆系统,这些将为全基因组提供的工具系统的功能分析,达到一个更深层次的了解复杂的生物学过程。结果:在这里,我们描述的代full-ORF应用网关克隆技术克隆人类基因资源(表达载体)。管道高效克隆和测序样品开发和跟踪数据库实现简化克隆生产针对超过2200个不同的子过程。此外,建立健壮的克隆策略,允许同时生成两个克隆变异包含一个特定的子以及没有终止密码子的实现只有一个额外的工作进入克隆过程。高达92%的目标并成功放大通过PCR和超过93%的扩增子成功克隆。结论:德国cDNA财团ORFeome资源目前有3800多块骨头组成,sequence-verified条目克隆代表羊痘疮,克隆并没有终止密码子,约1700种不同的基因位点。177年拼接代表121个基因变异被克隆。 The entry clones have been used to generate over 5,000 different expression constructs, providing the basis for functional profiling applications. As a member of the recently formed international ORFeome collaboration we substantially contribute to generating and providing a whole genome human ORFeome collection in a unique cloning system that is made freely available in the community.

DrugBank数据引用了这篇文章

多肽

的名字	UniProt ID
NAD (P) transhydrogenase,线粒体	Q13423	细节
异柠檬酸脱氢酶(NAD)α亚基,线粒体	P50213	细节
3 beta-hydroxysteroid脱氢酶/δ5 - - > 4-isomerase 2型	P26439	细节
铁蛋白轻链	P02792	细节
S-adenosylmethionine脱羧酶酶原	P17707	细节
酮亚胺还原酶mu-crystallin	Q14894	细节
腺嘌呤phosphoribosyltransferase	P07741	细节
雌激素受体	P03372	细节
溶质载体家庭12成员6	Q9UHW9	细节
双官能谷氨酸/脯氨酸——tRNA连接酶	P07814	细节
溶质载体家庭12成员7	Q9Y666	细节
Sodium-coupled中性氨基酸转运体3	Q99624	细节
国民幸福指数/ 6 pgl内质的双功能蛋白	O95479	细节
鸟氨酸转氨酶,线粒体	P04181	细节
Abelson酪氨酸受体激酶2	P42684	细节
白氨酸羧基甲基转移酶1	Q9UIC8	细节
NADH脱氢酶(辅酶q) 1α复形单元5	Q16718	细节
异亮氨酸tRNA连接酶,胞质	P41252	细节
视网膜脱氢酶2	O94788	细节
Branched-chain-amino-acid转氨酶,胞质	P54687	细节
血清白蛋白	P02768	细节
Proton-coupled氨基酸转运体1	Q7Z2H8	细节
异柠檬酸脱氢酶(NAD)β亚基,线粒体	O43837	细节
阳离子氨基酸转运蛋白2	P52569	细节
精胺氧化酶	Q9NWM0	细节
短/支链具体酰coa脱氢酶、线粒体	P45954	细节
角鲨烯单氧酶	Q14534	细节
溶质载体家庭13个成员3	Q8WWT9	细节
Monocarboxylate转运体1	P53985	细节
磷脂酰丝氨酸脱羧酶酶原	Q9UG56	细节
酸感性离子通道2	Q16515	细节
半胱氨酸- tRNA连接酶,胞质	P49589	细节
天冬氨酸——tRNA连接酶,胞质	P14868	细节
N (G)、N (G) -dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1	O94760	细节
糖皮质激素受体	P04150	细节
谷胱甘肽S-transferase A4	O15217	细节
谷胱甘肽S-transferaseω₁	P78417	细节
脂肪酸desaturase 1	O60427	细节
Calpastatin	P20810	细节
Alpha-2-macroglobulin	P01023	细节
胞质10-formyltetrahydrofolate脱氢酶	O75891	细节
血管紧张素转换酶2	Q9BYF1	细节
突触囊泡糖蛋白2 a	Q7L0J3	细节
细胞色素c	P99999	细节
溶质载体有机阴离子转运蛋白家族成员2 b1	O94956	细节
弹性蛋白	P15502	细节
Proton-coupled叶酸运输车	Q96NT5	细节
85/88 kDa calcium-independent磷脂酶A2	O60733	细节
鸟嘌呤nucleotide-binding蛋白G (I) / G (S) / G (O)亚基gamma-2	P59768	细节
不活跃的磷脂酶c蛋白1	Q15111	细节
核因子NF-kappa-B施敏原著亚基	P19838	细节
CD44抗原	P16070	细节
膜联蛋白A2	P07355	细节
纤连蛋白	P02751	细节
醌氧化还原酶	Q08257	细节
改变蛋白质RhoA	P61586	细节
视紫红质	P08100	细节
异柠檬酸脱氢酶(辅酶ii)胞质	O75874	细节
双重适配器phosphotyrosine和3-phosphotyrosine 3-phosphoinositide	Q9UN19	细节
组织蛋白酶F	Q9UBX1	细节
白三烯4水解酶	P09960	细节
死亡率蛋白激酶1	P53355	细节
脂肪酸结合蛋白,大脑	O15540	细节
Serpin B5	P36952	细节
Estrogen-related受体γ	P62508	细节
补充C1r子组件	P00736	细节
血浆丝氨酸蛋白酶抑制剂	P05154	细节
多种凝血因子缺乏蛋白质2	Q8NI22	细节
Synaptotagmin-like蛋白4	Q96C24	细节
Neuropilin-1	O14786	细节
组织蛋白酶L1	P07711	细节
Vesicle-associated膜蛋白1	P23763	细节
Serpin B6	P35237	细节
SPARC	P09486	细节
犬尿氨酸——氧化戊二酸转氨酶3	Q6YP21	细节
酸性氨基酸脱羧酶GADL1	Q6ZQY3	细节
钼辅因子sulfurase	Q96EN8	细节
O-phosphoseryl-tRNA (Sec)硒转移酶	Q9HD40	细节
Methylmalonic酸尿和C型高胱氨酸尿蛋白	Q9Y4U1	细节
胆碱transporter-like蛋白4	Q53GD3	细节
胆碱transporter-like蛋白2	Q8IWA5	细节
胆碱/ ethanolaminephosphotransferase 1	Q9Y6K0	细节
2-oxoglutarate和iron-dependent加氧酶domain-containing蛋白2	Q6N063	细节
Egl九同族体2	Q96KS0	细节
Egl九同族体1	Q9GZT9	细节
跨膜prolyl 4-hydroxylase	Q9NXG6	细节
多功能蛋白ADE2	P22234	细节
谷氨酰胺合成酶	P15104	细节
脂肪酸desaturase 2	O95864	细节
beta 1, 4-galactosyltransferase 4	O60513	细节
beta 1, 4-galactosyltransferase 2	O60909	细节
5-oxoprolinase	O14841	细节
可能的谷氨酸,tRNA连接酶、线粒体	Q5JPH6	细节
磷脂酰丝氨酸合酶2	Q9BVG9	细节
短链脱氢酶/还原酶3	O75911	细节
复合维生素K环氧还原酶亚基1蛋白1	Q8N0U8	细节
可能的脯氨酸——tRNA连接酶、线粒体	Q7L3T8	细节
蛋白酶体亚基β5型	P28074	细节
蛋白质治疗/ geranylgeranyltransferase 1型α亚基	P49354	细节
E3 ubiquitin-protein连接酶UBR4	Q5T4S7	细节
Telomerase-binding蛋白质EST1A	Q86US8	细节
低氧诱导因子1α抑制剂	Q9NWT6	细节
Kinesin-like蛋白质KIF1A	Q12756	细节
肝细胞的核因子4-gamma	Q14541	细节
致命的恶性大脑肿瘤蛋白1 (3)	Q9Y468	细节
炭疽毒素受体2	P58335	细节
NAD-dependent蛋白质deacylase sirtuin-5,线粒体	Q9NXA8	细节
高迁移率蛋白B1组	P09429	细节
肿瘤坏死因子受体超家族成员10 b	O14763	细节
Ribosome-binding蛋白1	Q9P2E9	细节
Microtubule-associated蛋白4	P27816	细节
大满贯家庭成员7	Q9NQ25	细节
Bcl-2-like蛋白1	Q07817	细节
组蛋白脱乙酰酶7	Q8WUI4	细节
组蛋白脱乙酰酶10	Q969S8	细节
核受体ROR-beta	Q92753	细节
视杆rhodopsin-sensitive cGMP 3 ', 5 '环磷酸二酯酶亚基γ	P18545	细节
前列腺素还原酶2	Q8N8N7	细节
钙/ calmodulin-dependent 3 ', 5 '环核苷酸磷酸二酯酶1 a	P54750	细节
整合素beta 1	P05556	细节
Nischarin	Q9Y2I1	细节
γ-氨基丁酸受体亚基gamma 1	Q8N1C3	细节
Ribonucleoside-diphosphate还原酶亚基M2 B	Q7LG56	细节
胃三酰甘油脂肪酶	P07098	细节
高亲和力铜吸收蛋白质1	O15431	细节
耐多药resistance-associated蛋白7	Q5T3U5	细节
溶质载体有机阴离子转运蛋白家族成员1 c1	Q9NYB5	细节
高亲和力cAMP-specific IBMX-insensitive 3 ', 5 '环磷酸二酯酶8 b	O95263	细节
Receptor-type酪氨酸受体磷酸酶β	P23467	细节
60年代核糖体蛋白由于	P84098	细节
电子转移flavoprotein-ubiquinone氧化还原酶、线粒体	Q16134	细节
Myosin-14	Q7Z406	细节
Glycodelin	P09466	细节
二氢叶酸还原酶、线粒体	Q86XF0	细节
保利(ADP-ribose)聚合酶3	Q9Y6F1	细节
延长因子图GTP-binding domain-containing蛋白质1	Q7Z2Z2	细节
Arylacetamide deacetylase-like 2	Q6P093	细节
过氧化物酶病acyl-coenzyme氧化酶1	Q15067	细节
MKL / myocardin-like蛋白1	Q969V6	细节
蛋白质尖顶同族体2	Q8WWL2	细节
丝氨酸/ threonine-protein磷酸酶催化亚基α2 b同种型	Q08209	细节
Actin-related蛋白2	P61160	细节
酪蛋白激酶gamma 1。我对碘氧基苯甲醚	Q9HCP0	细节
贩卖蛋白质粒子复杂的亚基6 b	Q86SZ2	细节
Afadin	P55196	细节
II型肌醇1 4 5-trisphosphate 5-phosphatase	P32019	细节
tRNA-splicing连接酶RtcB同族体	Q9Y3I0	细节
柠檬酸合成酶,线粒体	O75390	细节
尿苷5 '一磷酸合酶	P11172	细节
cAMP-dependent蛋白激酶催化β亚基	P22694	细节
Ras-related蛋白质Rab-8B	Q92930	细节
Inositol-3-phosphate合酶1	Q9NPH2	细节
Fumarylacetoacetase	P16930	细节
ADP-ribosylation因子蛋白1	P40616	细节
NAD-dependent蛋白脱乙酰酶sirtuin-3,线粒体	Q9NTG7	细节
T-complex蛋白质1亚基γ	P49368	细节
N-acylneuraminate cytidylyltransferase	Q8NFW8	细节
磷酸丝氨酸磷酸酶	P78330	细节
Pyrroline-5-carboxylate还原酶3	Q53H96	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶TAO2	Q9UL54	细节
Polycomb蛋白质SCMH1	Q96GD3	细节
Carbamoyl-phosphate合成酶(氨),线粒体	P31327	细节
碳酸氢钠转运蛋白3	Q9Y6M7	细节
电中性的碳酸氢钠换热器1	Q2Y0W8	细节
碳酸氢氯化Sodium-driven换热器	Q6U841	细节
古柯碱酯酶	O00748	细节
细胞色素P450 4 f12	Q9HCS2	细节
多种药物和毒素挤压蛋白2	Q86VL8	细节
蛋白质cereblon	Q96SW2	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶Nek11	Q8NG66	细节
Ephrin a受体5	P54756	细节
Alpha-enolase	P06733	细节
Protocadherin-19	Q8TAB3	细节
Hephaestin-like蛋白1	Q6MZM0	细节
核酸内切酶8-like 2	Q969S2	细节
组蛋白脱乙酰酶11	Q96DB2	细节
Calcium-dependent分泌激活1	Q9ULU8	细节
Calcium-dependent分泌激活2	Q86UW7	细节
二酰基甘油O-acyltransferase 2	Q96PD7	细节
异构核核糖核蛋白H3	P31942	细节
蛋白质RIC-3	Q7Z5B4	细节
微管蛋白monoglycylase TTLL3	Q9Y4R7	细节
剪接因子3 b亚基3	Q15393	细节
原肌球蛋白alpha -链	P09493	细节
Clusterin	P10909	细节
异染色质蛋白质1-binding 3	Q5SSJ5	细节
N-acyl-phosphatidylethanolamine-hydrolyzing磷脂酶D	Q6IQ20	细节
Myosin-9	P35579	细节
压敏电阻器钙通道亚基α2 / delta 4	Q7Z3S7	细节
非典型激酶COQ8A,线粒体	Q8NI60	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶33	Q9BYT3	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶36	Q9NRP7	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶TAO3	Q9H2K8	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶TNNI3K	Q59H18	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶ULK3	Q6PHR2	细节
BMP-2-inducible蛋白激酶	Q9NSY1	细节
钙/ calmodulin-dependent蛋白激酶激酶2	Q96RR4	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶DCLK2	Q8N568	细节
真核翻译起始因子2α激酶1	Q9BQI3	细节
eIF-2-alpha激酶GCN2	Q9P2K8	细节
Ephrin a受体6	Q9UF33	细节
富亮氨酸重复丝氨酸/ threonine-protein激酶2	Q5S007	细节
增殖蛋白激酶激酶激酶3	Q99759	细节
增殖蛋白激酶激酶激酶激酶4	O95819	细节
地图kinase-activated蛋白激酶5	Q8IW41	细节
CLIP-associating蛋白1	Q7Z460	细节
Megakaryocyte-associated酪氨酸受体激酶	P42679	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶Nek1	Q96PY6	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶PAK 4	O96013	细节
膜相关的酪氨酸,threonine-specific cdc2-inhibitory激酶	Q99640	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶RIO1	Q9BRS2	细节
SNF-related丝氨酸/ threonine-protein激酶	Q9NRH2	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶10	O94804	细节
Exportin-1	O14980	细节
增殖蛋白激酶6	Q16659	细节
43溶质载体家庭成员3	Q8NBI5	细节
Lysophosphatidic酸受体6	P43657	细节
溶质载体家庭41成员1	Q8IVJ1	细节
Y + L氨基酸转运蛋白2	Q92536	细节
受体视黄醇STRA6吸收	Q9BX79	细节
锌转运体ZIP10	Q9ULF5	细节
锌转运蛋白7	Q8NEW0	细节
锌转运体8	Q8IWU4	细节
锌转运蛋白5	Q8TAD4	细节
锌转运体10	Q6XR72	细节
锌转运体ZIP13	Q96H72	细节
锌转运蛋白6	Q6NXT4	细节
二酰基甘油激酶埃塔	Q86XP1	细节
v型质子atp酶亚基e 2	Q8NHE4	细节
v型质子atp酶1。116 kDa亚基对碘氧基苯甲醚	Q93050	细节
质膜calcium-transporting atp酶4	P23634	细节
Calcium-transporting atp酶2型c成员2	O75185	细节
PI-PLC X domain-containing蛋白质3	Q63HM9	细节
Lysine-specific组蛋白demethylase 1	O60341	细节
信号传感器和转录激活1α/β	P42224	细节
核转录因子2红细胞两个相关因素	Q16236	细节
3-oxoacyl -酰基载体蛋白质还原酶	Q8N4T8	细节
免疫球蛋白受体FcRn大亚基多样	P55899	细节