赖氨酸乙酰化靶向蛋白质复合物并共同调节主要细胞功能。
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引用
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乔杜里C,库马尔C,格纳德F,尼尔森ML,拉赫曼M,瓦尔特TC,奥尔森JV,曼恩M
赖氨酸乙酰化靶向蛋白质复合物并共同调节主要细胞功能。
科学学报。2009年8月14日;325(5942):834-40。doi: 10.1126 / science.1175371。Epub 2009 7月16日。
- PubMed ID
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19608861 (PubMed视图]
- 摘要
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赖氨酸乙酰化是一种可逆的蛋白质翻译后修饰,在调节基因表达中起着关键作用。到目前为止,技术限制阻碍了对赖氨酸乙酰化的细胞作用进行全球分析。我们使用高分辨率质谱法鉴定了1750个蛋白质上的3600个赖氨酸乙酰化位点,并定量了乙酰化对去乙酰化酶抑制剂亚eroylanilide羟肟酸和MS-275的响应。赖氨酸乙酰化优先针对参与不同细胞过程的大分子复合物,如染色质重塑、细胞周期、剪接、核转运和肌动蛋白成核。乙酰化破坏14-3-3磷酸化依赖的相互作用,并调节酵母周期蛋白依赖的激酶Cdc28。我们的数据表明,赖氨酸乙酰化的调控范围是广泛的,可与其他主要的翻译后修饰。
引用本文的药物库数据
- 多肽
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的名字 UniProt ID NAD(P)转氢化酶,线粒体 Q13423 细节 异柠檬酸脱氢酶[NAD]亚单位α,线粒体 P50213 细节 苯丙氨酸-tRNA连接酶,线粒体 O95363 细节 苯丙氨酸-tRNA连接酶α亚基 Q9Y285 细节 转酮醇酶 P29401 细节 丝氨酸-tRNA连接酶,细胞质 P49591 细节 丙酮酸脱氢酶复合物的二氢脂酰赖氨酸残基乙酰转移酶组分,线粒体 P10515 细节 l -乳酸脱氢酶B链 P07195 细节 乙酰辅酶a乙酰转移酶,线粒体 P24752 细节 丙酮酸激酶PKM P14618 细节 腺嘌呤phosphoribosyltransferase P07741 细节 血红蛋白亚单位 P69905 细节 微管蛋白链 P07437 细节 依赖nadd的苹果酶,线粒体 P23368 细节 琥珀酸半醛脱氢酶,线粒体 P51649 细节 nadh -细胞色素b5还原酶 P00387 细节 2-羟戊二酸脱氢酶,线粒体 Q02218 细节 琥珀酸脱氢酶[泛醌]黄蛋白亚基,线粒体 P31040 细节 谷氨酸脱氢酶1,线粒体 P00367 细节 双功能谷氨酸/脯氨酸-tRNA连接酶 P07814 细节 赖氨酸- tRNA连接酶 Q15046 细节 nedd8激活酶E1调节亚基 Q13564 细节 可能是亮氨酸——tRNA连接酶,线粒体 Q15031 细节 天冬酰胺合成酶[谷氨酰胺水解] P08243 细节 缬氨酸——tRNA连接酶 P26640 细节 色氨酸——tRNA连接酶,细胞质 P23381 细节 酪氨酸-tRNA连接酶,细胞质 P54577 细节 苏氨酸-tRNA连接酶,细胞质 P26639 细节 三功能酶亚单位α,线粒体 P40939 细节 双功能亚甲基四氢叶酸脱氢酶/环水解酶,线粒体 P13995 细节 二胺乙酰转移酶 Q96F10 细节 4-trimethylaminobutyraldehyde脱氢酶 P49189 细节 丝氨酸羟甲基转移酶,线粒体 P34897 细节 丙氨酸-tRNA连接酶,细胞质 P49588 细节 s -腺苷蛋氨酸合成酶异构体2型 P31153 细节 GMP合成酶[谷氨酰胺水解] P49915 细节 二磷酸核糖核苷还原酶大亚基 P23921 细节 丝氨酸羟甲基转移酶,细胞质 P34896 细节 甘氨酸氨基转移酶,线粒体 P50440 细节 乙酰辅酶A合成酶,细胞质 Q9NR19 细节 琥珀酰辅酶a连接酶[gdp形成]亚单位β,线粒体 Q96I99 细节 酪氨酸-tRNA连接酶,线粒体 Q9Y2Z4 细节 羟酰辅酶A脱氢酶,线粒体 Q16836 细节 天门冬氨酸转氨酶,线粒体 P00505 细节 异戊二醛辅酶a脱氢酶,线粒体 P26440 细节 过氧化物酶体多功能酶2型 P51659 细节 钙调蛋白 P0DP23 细节 膜联蛋白A1 P04083 细节 乳酸脱氢酶A链 P00338 细节 NADH脱氢酶[泛醌]1 α亚复合物亚基5 Q16718 细节 苏氨酸合成酶样1 Q8IYQ7 细节 肉碱O-acetyltransferase P43155 细节 Glyceraldehyde-3-phosphate脱氢酶 P04406 细节 视网膜脱氢酶1 P00352 细节 异柠檬酸脱氢酶[NAD]亚单位β,线粒体 O43837 细节 丙酮酸脱氢酶E1组成亚单位α,体细胞,线粒体 P08559 细节 短链/支链特异性酰基辅酶a脱氢酶,线粒体 P45954 细节 过氧化物酶体双功能酶 Q08426 细节 苹果酸脱氢酶,细胞质 P40925 细节 ADP/ATP转位酶1 P12235 细节 磷酸丝氨酸转氨酶 Q9Y617 细节 谷氨酸-半胱氨酸连接酶调节亚基 P48507 细节 天冬酰胺-tRNA连接酶,细胞质 O43776 细节 胆碱-磷酸胞基转移酶A P49585 细节 ADP/ATP转位酶3 P12236 细节 乙酰辅酶a羧化酶 Q13085 细节 UMP-CMP激酶 P30085 细节 UDP-glucose 6-dehydrogenase O60701 细节 丙酮酸羧化酶,线粒体 P11498 细节 半胱氨酸-tRNA连接酶,细胞质 P49589 细节 ADP/ATP转位酶2 P05141 细节 乙醛脱氢酶,二聚nadp偏好 P30838 细节 支链氨基酸转氨酶,线粒体 O15382 细节 肌苷-5'-单磷酸脱氢酶2 P12268 细节 天门冬氨酸-tRNA连接酶,细胞质 P14868 细节 二氢硫辛酸脱氢酶,线粒体 P09622 细节 胆绿素还原酶A P53004 细节 乙酰辅酶A合成酶2样,线粒体 Q9NUB1 细节 醛糖还原酶 P15121 细节 法尼基焦磷酸合成酶 P14324 细节 鞘氨脂-1-磷酸裂解酶1 O95470 细节 苹果酸脱氢酶,线粒体 P40926 细节 烟酰胺N-methyltransferase P40261 细节 谷胱甘肽s转移酶1 Q9Y2Q3 细节 谷胱甘肽s转移酶P P09211 细节 谷胱甘肽s -转移酶-1 P78417 细节 Maleylacetoacetate异构酶 O43708 细节 谷氨酰胺酶肾亚型,线粒体 O94925 细节 Perilipin-3 O60664 细节 CTP合成酶1 P17812 细节 三功能嘌呤生物合成蛋白腺苷-3 P22102 细节 周期蛋白依赖样激酶5 Q00535 细节 DNA(胞嘧啶-5)甲基转移酶1 P26358 细节 Peroxiredoxin-5,线粒体 P30044 细节 生长因子受体结合蛋白2 P62993 细节 双功能环氧化物水解酶2 P34913 细节 脂肪酸合成酶 P49327 细节 二氢嘧啶脱氢酶[NADP(+)] Q12882 细节 Lactoylglutathione裂合酶 Q04760 细节 DNA拓扑异构酶 P11387 细节 Thiopurine S-methyltransferase P51580 细节 甘氨酸- tRNA连接酶 P41250 细节 细胞色素b-c1复合体亚基1,线粒体 P31930 细节 细胞色素c P99999 细节 Calnexin P27824 细节 肽酰脯氨酸顺反异构酶A P62937 细节 rho相关蛋白激酶1 Q13464 细节 周期蛋白依赖性激酶2 P24941 细节 周期蛋白依赖性激酶1 P06493 细节 Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase P11413 细节 热休克蛋白hsp90 - α P07900 细节 蛋白激酶C α型 P17252 细节 14-3-3蛋白质zeta/delta P63104 细节 醌氧化还原酶 Q08257 细节 Glucose-6-phosphate异构酶 P06744 细节 过氧化氢酶 P04040 细节 m7GpppX diphosphatase Q96C86 细节 Thymidylate激酶 P23919 细节 双功能嘌呤生物合成蛋白PURH P31939 细节 异柠檬酸脱氢酶(NADP O75874 细节 酪氨酸蛋白激酶ZAP-70 P43403 细节 乙酰辅酶a乙酰转移酶,胞质 Q9BWD1 细节 微管蛋白- 4b链 P68371 细节 微管蛋白-3链 Q13509 细节 组氨酸三核苷酸结合蛋白1 P49773 细节 磷脂酰肌醇转移蛋白α亚型 Q00169 细节 葡萄糖胺-6-磷酸异构酶 P46926 细节 白三烯A-4水解酶 P09960 细节 二磷酸果糖醛缩酶A P04075 细节 聚[adp -核糖]聚合酶 P09874 细节 中链特异性酰基辅酶a脱氢酶,线粒体 P11310 细节 enyl - coa δ异构酶1,线粒体 P42126 细节 羟酰谷胱甘肽水解酶,线粒体 Q16775 细节 激酶样蛋白KIF11 P52732 细节 巨噬细胞迁移抑制因子 P14174 细节 热休克蛋白hsp90 - β P08238 细节 脂肪酸结合蛋白,表皮 Q01469 细节 角蛋白,II型细胞骨架 P05787 细节 Calreticulin P27797 细节 Retinoblastoma-associated蛋白质 P06400 细节 Prolyl肽链内切酶 P48147 细节 犬尿氨酸-羟戊二酸转氨酶3 Q6YP21 细节 周期蛋白依赖性激酶6 Q00534 细节 腺苷脱氨酶 P00813 细节 三甲基赖氨酸双加氧酶,线粒体 Q9NVH6 细节 多功能蛋白ADE2 P22234 细节 CAD蛋白质 P27708 细节 天门冬氨酸-tRNA连接酶,线粒体 Q6PI48 细节 谷氨酰胺,tRNA连接酶 P47897 细节 琥珀酰辅酶a连接酶[ADP/ gdp形成]亚单位α,线粒体 P53597 细节 琥珀酰辅酶A:3-酮酸辅酶A转移酶1,线粒体 P55809 细节 琥珀酰辅酶a连接酶[adp形成]亚单位β,线粒体 Q9P2R7 细节 可能是谷氨酸-tRNA连接酶,线粒体 Q5JPH6 细节 S-formylglutathione水解酶 P10768 细节 视黄醇脱氢酶11 Q8TC12 细节 二酰基甘油激酶 P23743 细节 异亮氨酸——tRNA连接酶,线粒体 Q9NSE4 细节 可能是天冬酰胺-tRNA连接酶,线粒体 Q96I59 细节 蛋白酶体亚单位β -1型 P20618 细节 组蛋白去乙酰化酶 Q13547 细节 dna依赖性蛋白激酶催化亚基 P78527 细节 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶mTOR P42345 细节 超氧化物歧化酶[Cu-Zn] P00441 细节 DNA-(无嘌呤或无嘧啶位点)裂解酶 P27695 细节 角蛋白,II型细胞骨架 P08729 细节 E3泛素蛋白连接酶UBR4 Q5T4S7 细节 电压依赖性阴离子选择通道蛋白1 P21796 细节 电压依赖性阴离子选择通道蛋白2 P45880 细节 电压依赖性阴离子选择通道蛋白3 Q9Y277 细节 前列腺素E合成酶3 Q15185 细节 U1小核核糖核蛋白A P09012 细节 atp依赖性Clp蛋白酶的蛋白水解亚基,线粒体 Q16740 细节 蛋白质S100-A11 P31949 细节 铜转运蛋白ATOX1 O00244 细节 蛋白质S100-A6 P06703 细节 2,4-二烯酰辅酶a还原酶,线粒体 Q16698 细节 丝氨酸/苏氨酸-蛋白磷酸酶 P53041 细节 核苷二磷酸激酶B P22392 细节 羟甲基戊二酰辅酶a裂解酶,线粒体 P35914 细节 细胞肿瘤抗原p53 P04637 细节 高迁移率族蛋白B1 P09429 细节 热休克蛋白β -1 P04792 细节 转录激活因子Myb P10242 细节 组蛋白去乙酰化酶5 Q9UQL6 细节 6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶,脱羧 P52209 细节 整合素beta 1 P05556 细节 脱氧鸟苷激酶,线粒体 Q16854 细节 不依赖阳离子的甘露糖-6-磷酸受体 P11717 细节 肽基脯氨酸顺反异构酶 Q13526 细节 核受体共激活剂2 Q15596 细节 丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶2A 65 kDa调节亚基A α亚型 P30153 细节 Uracil-DNA糖基化酶 P13051 细节 热休克同源蛋白71 kDa P11142 细节 60S核糖体蛋白L13a P40429 细节 60S核糖体蛋白L37 P61927 细节 60S核糖体蛋白L3 P39023 细节 60S核糖体蛋白L11 P62913 细节 ATP合酶亚单位,线粒体 P25705 细节 ATP合酶亚单位,线粒体 P06576 细节 ATP合酶亚单位γ,线粒体 P36542 细节 Triosephosphate异构酶 P60174 细节 胞液氨肽酶 P28838 细节 蛋白酶体亚单位α -2型 P25787 细节 蛋白酶体亚单位α -3型 P25788 细节 蛋白酶体亚单位α -4型 P25789 细节 蛋白酶体亚单位α -6型 P60900 细节 蛋白酶体亚单位α -7型 O14818 细节 蛋白酶体亚单位β -3型 P49720 细节 酪蛋白激酶II亚基α ' P19784 细节 细胞色素c氧化酶亚基4亚型1,线粒体 P13073 细节 异戊基二磷酸δ异构酶1 Q13907 细节 延伸因子Tu gtp结合域含蛋白1 Q7Z2Z2 细节 羟甲基戊二酰辅酶a合成酶,细胞质 Q01581 细节 Profilin-1 P07737 细节 过氧化物酶体酰基辅酶A氧化酶 Q15067 细节 钙蛋白酶小亚基1 P04632 细节 膜联蛋白A5 P08758 细节 Destrin P60981 细节 Cofilin-1 P23528 细节 enyl - coa δ异构酶2,线粒体 O75521 细节 肌动蛋白相关蛋白2/3复合亚基1B O15143 细节 肌动蛋白相关蛋白2 P61160 细节 肌动蛋白相关蛋白3 P61158 细节 肌动蛋白相关蛋白2/3复合亚基2 O15144 细节 肌动蛋白相关蛋白2/3复合亚基3 O15145 细节 延伸系数2 P13639 细节 3-羟基异丁基辅酶a水解酶,线粒体 Q6NVY1 细节 白介素-1受体相关激酶 Q9NWZ3 细节 蛋白质S100-A4 P26447 细节 醛酮还原酶家族1成员B10 O60218 细节 CREB-binding蛋白质 Q92793 细节 Valacyclovir水解酶 Q86WA6 细节 RNA聚合酶II转录亚基1的中介物 Q15648 细节 U6 snrna相关的sm样蛋白LSm6 P62312 细节 超氧化物歧化酶[Mn],线粒体 P04179 细节 磷酸甘油酸激酶 P00558 细节 硫代硫酸盐sulfurtransferase Q16762 细节 柠檬酸合成酶,线粒体 O75390 细节 Phosphoglucomutase-1 P36871 细节 波形蛋白 P08670 细节 细胞色素b5 B型 O43169 细节 Acyl-CoA-binding蛋白质 P07108 细节 Galectin-1 P09382 细节 烯酰辅酶a水合酶,线粒体 P30084 细节 附生水合酶,线粒体 Q99798 细节 异柠檬酸脱氢酶[NADP],线粒体 P48735 细节 延伸因子Tu,线粒体 P49411 细节 t复合蛋白1亚基 P49368 细节 gtp结合核蛋白Ran P62826 细节 14-3-3蛋白质 P62258 细节 [3-甲基-2-氧丁酸脱氢酶[脂酰胺]]激酶,线粒体 O14874 细节 泛素样修饰物激活酶1 P22314 细节 组蛋白乙酰转移酶KAT5 Q92993 细节 SWI/ snf相关基质相关肌动蛋白依赖调控因子染色质亚家族A成员 O60264 细节 谱蛋白链,非红细胞性1 Q01082 细节 剪接RNA解旋酶DDX39B Q13838 细节 肝细胞生长因子调节的酪氨酸激酶底物 O14964 细节 Peroxiredoxin-6 P30041 细节 原癌基因蛋白 P01106 细节 博来霉素水解酶 Q13867 细节 蛋白酶体亚基-9型 P28065 细节 3-beta-hydroxysteroid-Delta(8),δ(7)异构酶 Q15125 细节 ras相关C3肉毒毒素底物2 P15153 细节 补体成分1q子成分结合蛋白,线粒体 Q07021 细节 硫氧还蛋白 P10599 细节 氯离子胞内通道蛋白1 O00299 细节 酪蛋白激酶II亚单位β P67870 细节 转录因子p65 Q04206 细节 泛素羧基末端水解酶同工酶L1 P09936 细节 α -酮戊二酸依赖性双加氧酶FTO Q9C0B1 细节 Alpha-enolase P06733 细节 核仁和盘状体磷蛋白1 Q14978 细节 Peroxiredoxin-1 Q06830 细节 三羧酸转运蛋白,线粒体 P53007 细节 Tesmin Q9Y4I5 细节 Calmodulin-2 P0DP24 细节 Calmodulin-3 P0DP25 细节 60kda热休克蛋白,线粒体 P10809 细节 40S核糖体蛋白S2 P15880 细节 异质核核糖核蛋白A2/B1 P22626 细节 异质核核糖核蛋白L P14866 细节 剪接因子,富含脯氨酸和谷氨酰胺 P23246 细节 活化蛋白C激酶受体 P63244 细节 Alpha-actinin-1 P12814 细节 膜联蛋白A4 P09525 细节 Stress-induced-phosphoprotein 1 P31948 细节 真核起始因子4A-I P60842 细节 14-3-3蛋白β / α P31946 细节 肝癌源性生长因子 P51858 细节 ran特异性gtp酶激活蛋白 P43487 细节 cap特异性mRNA(核苷-2'- o -)甲基转移酶 Q8N1G2 细节 Copine-1 Q99829 细节 蛋白质RIC-3 Q7Z5B4 细节 Prohibitin-2 Q99623 细节 皮瓣内切酶1 P39748 细节 真核翻译起始因子3亚单位F O00303 细节 ATP合酶亚基g,线粒体 O75964 细节 异质核核糖核蛋白F P52597 细节 热休克70 kDa蛋白4 P34932 细节 10 kDa热休克蛋白,线粒体 P61604 细节 核迁移蛋白 Q9Y266 细节 蛋白质S100-A10 P60903 细节 剪接因子3A亚基3 Q12874 细节 原肌凝蛋白-1链 P09493 细节 原肌凝蛋白-3链 P06753 细节 原肌凝蛋白-4链 P67936 细节 泛素羧基末端水解酶14 P54578 细节 14-3-3蛋白质θ P27348 细节 增殖细胞核抗原 P12004 细节 Dermcidin P81605 细节 ATP合酶亚基O,线粒体 P48047 细节 富含半胱氨酸和甘氨酸的蛋白1 P21291 细节 Filamin-A P21333 细节 异质核核糖核蛋白D0 Q14103 细节 Nucleophosmin P06748 细节 60S核糖体蛋白L14 P50914 细节 60S核糖体蛋白L35 P42766 细节 60S核糖体蛋白L4 P36578 细节 40S核糖体蛋白S13 P62277 细节 40S核糖体蛋白S18 P62269 细节 40S核糖体蛋白S19 P39019 细节 40S核糖体蛋白S5 P46782 细节 40S核糖体蛋白S6 P62753 细节 40S核糖体蛋白S9 P46781 细节 Transgelin-2 P37802 细节 Zyxin Q15942 细节 丝氨酸/精氨酸富剪接因子1 Q07955 细节 Myosin-9 P35579 细节 可能依赖于atp的RNA解旋酶DDX5 P17844 细节 剪接因子3B亚基1 O75533 细节 STE20/ sps1相关富脯氨酸-丙氨酸蛋白激酶 Q9UEW8 细节 香橼铑相互作用激酶 O14578 细节 酪蛋白激酶I亚型 P48729 细节 eif -2-激酶GCN2 Q9P2K8 细节 丝裂原活化蛋白激酶激酶5 Q9Y4K4 细节 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶PAK 2 Q13177 细节 磷脂酰肌醇5-磷酸4-激酶2型β P78356 细节 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶N1 Q16512 细节 丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶PRP4同源物 Q13523 细节 Exportin-1 O14980 细节 Prohibitin P35232 细节 电压门控钾通道亚单位β -2 Q13303 细节 镁转运蛋白MRS2同源物,线粒体 Q9HD23 细节 atp柠檬酸合酶 P53396 细节 载脂蛋白b - 100 P04114 细节 增殖标志蛋白Ki-67 P46013 细节 组蛋白乙酰转移酶p300 Q09472 细节