吡哆醛激酶与罗斯维汀及其衍生物配合物的晶体结构。

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唐亮、李敏敏、曹鹏、王芳、常文荣、巴赫S、莱因哈特J、Ferandin Y、Galons H、万莹、格雷N、梅杰尔L、江涛、梁dc

吡哆醛激酶与罗斯维汀及其衍生物配合物的晶体结构。

生物化学杂志2005年9月2日;280(35):31220-9。Epub 2005年6月28日。

PubMed ID

15985434 (查看PubMed

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摘要

吡哆醛激酶(PDXK)在ATP和Zn2+的存在下催化吡哆醛、吡哆胺和吡哆嘧啶的磷酸化。这是合成吡哆醛5'-磷酸(PLP)的关键步骤，是维生素B6的活性形式，是140多种酶的辅助因子。(R)-Roscovitine (CYC202, Seliciclib)是一种相对选择性的细胞周期蛋白依赖性激酶(CDKs)抑制剂，目前被评估用于癌症、神经退行性疾病、肾脏疾病和几种病毒感染的治疗。亲和层析研究表明(R)-roscovitine也与PDXK相互作用。为了理解这种相互作用，我们测定了PDXK与(R)-roscovitine、n6 -甲基-(R)-roscovitine和O6-(R)-roscovitine配合物的晶体结构，后两种衍生物被设计为与PDXK结合，但不与CDKs结合。结构分析显示，这三种roscovitine与PDXK的吡哆酮结合位点相似，而不是预期的atp结合位点。因此，吡哆醛口袋具有一种意想不到的容纳不同于吡哆醛或比吡哆醛大的分子的能力。这项工作提供了PDXK与roscovitine及其类似物相互作用的详细结构信息。这也有助于设计对PDXK或CDKs具有严格选择性的roscovitine衍生物。

引用本文的药库数据

药物靶点

药物	目标	种类	生物	药理作用	行动
吡哆醛	吡哆醛激酶	蛋白质	人类	是的	不可用	细节

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
Seliciclib	周期蛋白依赖性激酶2	IC 50 (nM)	400	7.2	30.	细节
Seliciclib	丝裂原激活蛋白激酶1	IC 50 (nM)	22000	7.2	30.	细节