人类19号染色体的DNA序列和生物学。
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Grimwood J,奥尔森,戈登·拉特里,污物J, Lamerdin J, Hellsten U,古德斯坦D,花边外缘饰圈啊,Tran-Gyamfi M, Aerts, Altherr M, Ashworth L, Bajorek E,黑色的年代,Branscomb E, Caenepeel年代,卡里诺,Caoile C,陈YM,克里斯滕森M,克莱兰德CA,科普兰,Dalin E, Dehal P,丹尼斯M,德JC, Escobar J,鲜花D, Fotopulos D,加西亚C, Georgescu, Glavina T,戈麦斯M,冈萨雷斯E, Groza M, Hammon N,霍金斯T, Haydu L,何我,黄W, Israni年代,杰特J, Kadner K,金博H,小林,Larionov V, Leem SH,洛佩兹F,卢Y,洛瑞,极糟,马丁内斯D, McCready P,麦地那C,摩根J,纳尔逊·K,诺兰M, Ovcharenko我Pitluck年代,波拉德M, Popkie美联社,Predki P,关丽珍G,拉米雷斯L,皮疹,Retterer J,罗德里格斯,罗杰斯,Salamov,萨拉查,她X,史密斯D, Slezak T, Solovyev V,泰尔N,泰斯H,蔡M, Ustaszewska,签证官N,瓦格纳M,惠勒J, K,谢G,杨J, Dubchak我,弗瑞TS,德琼P,迪克森,戈登•D为EE, Pennacchio洛杉矶,理查森P,斯塔布斯L,Rokhsar DS, Myers RM, Rubin EM, Lucas SM
人类19号染色体的DNA序列和生物学。
自然科学。2004年4月1日;428(682):529-35。
- PubMed ID
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15057824 (PubMed视图]
- 摘要
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19号染色体是所有人类染色体中基因密度最高的,是全基因组平均水平的两倍多。大的聚集基因家族、相应的高G + C含量、CpG岛和重复DNA密度表明该染色体具有丰富的生物学和进化意义。在这里,我们描述了5580万个碱基对的高度精确的完成序列,代表染色体的99.9%的常染色质部分。基因座的手工整理显示了1461个蛋白编码基因和321个假基因。在这些基因中,直接涉及孟德尔疾病,包括家族性高胆固醇血症和胰岛素抵抗性糖尿病。近四分之一的这些基因属于串联排列的家族,包含超过25%的染色体。比较分析显示了一幅令人着迷的保护和分歧的图片,揭示了与啮齿动物的基因同源性的大块,最近基因家族扩展和缺失的分散区域,以及与遥远的鱼类Takifugu的编码和非编码保护片段。
引用本文的药物库数据
- 多肽
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的名字 UniProt ID 胰岛素受体 P06213 细节 苯丙氨酸-tRNA连接酶α亚基 Q9Y285 细节 铁蛋白轻链 P02792 细节 癌胚抗原相关细胞粘附分子 P13688 细节 b细胞受体CD22 P20273 细节 DNA连接酶1 P18858 细节 中性氨基酸转运蛋白B(0) Q15758 细节 NADH脱氢酶[泛醌]铁硫蛋白7,线粒体 O75251 细节 钾转运atp酶α链1 P20648 细节 电压依赖性P/ q型钙通道亚基α - 1a O00555 细节 鸟氨酸脱羧酶抗酶 P54368 细节 谷氨酸受体离子化,NMDA 2D O15399 细节 ATP合酶亚单位,线粒体 P30049 细节 低密度脂蛋白受体 P01130 细节 NADH脱氢酶[泛醌]1 α亚复合体亚基13 Q9P0J0 细节 谷氨酸受体促离子性,NMDA 3B O60391 细节 NADH脱氢酶[泛醌]1 α亚复合体亚基11 Q86Y39 细节 Guanidinoacetate N-methyltransferase Q14353 细节 视黄醇脱氢酶13 Q8NBN7 细节 黄素还原酶 P30043 细节 髓细胞表面抗原CD33 P20138 细节 肌酸激酶m型 P06732 细节 尿激酶纤溶酶原激活物表面受体 Q03405 细节 甘油醛-3-磷酸脱氢酶,睾丸特异性 O14556 细节 Ryanodine受体1 P21817 细节 腺苷三磷酸酶ASNA1 O43681 细节 血栓素A2受体 P21731 细节 Perilipin-3 O60664 细节 DNA(胞嘧啶-5)甲基转移酶1 P26358 细节 软骨寡聚基质蛋白 P49747 细节 Myeloblastin P24158 细节 fMet-Leu-Phe受体 P21462 细节 Kallikrein-1 P06870 细节 camp特异性3',5'-环磷酸二酯酶4A P27815 细节 磷脂过氧化氢谷胱甘肽过氧化物酶,线粒体 P36969 细节 Deoxyhypusine合酶 P49366 细节 rc - β丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 P31751 细节 Glucose-6-phosphate异构酶 P06744 细节 磺基转移酶家族细胞质2B成员1 O00204 细节 Kallikrein-6 Q92876 细节 羟甾醇受体lxr - P55055 细节 Galectin-10 Q05315 细节 戊二酰辅酶a脱氢酶,线粒体 Q92947 细节 Peroxiredoxin-2 P32119 细节 Calreticulin P27797 细节 胆碱转运体样蛋白2 Q8IWA5 细节 Egl九同源物2 Q96KS0 细节 兴奋性氨基酸转运蛋白4 P48664 细节 camp特异性3',5'-环磷酸二酯酶4C Q08493 细节 磷脂酰肌醇3-激酶调节亚单位β O00459 细节 鞘氨氮1-磷酸受体5 Q9H228 细节 Mucin-16 Q8WXI7 细节 丝氨酸/苏氨酸-蛋白磷酸酶 P53041 细节 酪蛋白激酶I亚型γ -2 P78368 细节 细胞色素P450 2A6 P11509 细节 低亲和力免疫球蛋白epsilon Fc受体 P06734 细节 KiSS-1受体 Q969F8 细节 酪氨酸蛋白激酶JAK3 P52333 细节 细胞色素P450 2B6 P20813 细节 受体型酪氨酸蛋白磷酸酶S Q13332 细节 钠通道亚单位β -1 Q07699 细节 细胞色素b-c1复合体Rieske亚单位,线粒体 P47985 细节 细胞色素b-c1复合体亚基10 O14957 细节 Myosin-14 Q7Z406 细节 细胞色素c氧化酶亚基6B1 P14854 细节 细胞色素c氧化酶亚基7A1,线粒体 P24310 细节 血小板活化因子乙酰水解酶IB亚基γ Q15102 细节 钙蛋白酶小亚基1 P04632 细节 癌胚抗原相关细胞粘附分子 P06731 细节 脊髓灰质炎病毒受体 P15151 细节 转运蛋白粒子复合亚基6A O75865 细节 Epsin-1 Q9Y6I3 细节 附睾精子结合蛋白1 Q96BH3 细节 肌醇-3-磷酸合酶1 Q9NPH2 细节 神经蛋白核心蛋白 O14594 细节 精氨酸n -甲基转移酶 Q99873 细节 极光激酶C Q9UQB9 细节 钾/钠超极化激活环核苷酸门控通道2 Q9UL51 细节 干扰素诱导的GTPase 5 Q6NXR0 细节 钾电压门控通道亚家族C成员3 Q14003 细节 叶醌-羟化酶CYP4F2 P78329 细节 细胞色素P450 4F12 Q9HCS2 细节 kelch样ech相关蛋白1 Q14145 细节 蛋白激酶C型 P05129 细节 循环amp依赖转录因子ATF-5 Q9Y2D1 细节 钠钾转运atp酶亚单位α -3 P13637 细节 Fibrillin-3 Q75N90 细节 Calmodulin-3 P0DP25 细节 Calcyphosin Q13938 细节 Calreticulin-3 Q96L12 细节 异质核核糖核蛋白L P14866 细节 剪接因子3A亚基2 Q15428 细节 前列腺特异性抗原 P07288 细节 妊娠特异性β -1糖蛋白5 Q15238 细节 RuvB-like 2 Q9Y230 细节 Alpha-1B-glycoprotein P04217 细节 淀粉样蛋白1 P51693 细节 远上游元件结合蛋白2 Q92945 细节 60S核糖体蛋白L18 Q07020 细节 40S核糖体蛋白S9 P46781 细节 小核核糖核蛋白Sm D2 P62316 细节 电压依赖性钙通道-8亚基 Q8WXS5 细节 钠/碘转运蛋白 Q92911 细节 酪氨酸蛋白激酶受体不明飞行物 P30530 细节 双特异性酪氨酸磷酸化调节激酶1B Q9Y463 细节 糖原合成酶激酶3 P49840 细节 丝裂原活化蛋白激酶1 Q92918 细节 微管相关丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 Q9Y2H9 细节 巨核细胞相关酪氨酸蛋白激酶 P42679 细节 MAP激酶相互作用丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶 Q9HBH9 细节 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶N1 Q16512 细节 未特征丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶SBK3 P0C264 细节 Hepcidin P81172 细节 鞘氨醇激酶2 Q9NRA0 细节 细胞色素P450 4F3 Q08477 细节 白细胞抗原CD37 P11049 细节 C5a过敏性毒素趋化受体1 P21730 细节 破骨细胞相关免疫球蛋白样受体 Q8IYS5 细节 elav样蛋白1 Q15717 细节 CD70抗原 P32970 细节 游离脂肪酸受体2 O15552 细节 游离脂肪酸受体3 O14843 细节 Interleukin-11 P20809 细节