结构性基础脂肪酸衬底cyclooxygenase-2绑定。

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Simmons DM,维奇AJ Malkowski毫克

结构性基础脂肪酸衬底cyclooxygenase-2绑定。

285年J生物化学杂志。2010年7月16日,(29):22152 - 63。doi: 10.1074 / jbc.M110.119867。2010年5月12日Epub。

PubMed ID

20463020 (在PubMed

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文摘

环氧酶(COX-1和cox - 2)膜相关heme-containing为产生前列腺素H(2)从花生四烯酸(AA)。虽然AA是首选衬底,其他脂肪酸含氧通过这些酶与不同的效率。我们确定晶体结构的AA,二十碳五烯酸(EPA)和二十二碳六烯酸(DHA)绑定到公司(3 +)原卟啉IX-reconstituted鼠cox - 2至2.1,2.4,和2.65,分别。AA、EPA和二十二碳六烯酸结合在不同构象在每个单体构成为在各自结构这样一个单体展品非生产性的绑定和其他生产性绑定环氧酶底物的通道。蛋白质和衬底之间的交互识别时绑定到COX-1 cox - 2的结构是守恒的,唯一的显著区别是缺乏互动的羧酸盐的AA和EPA arg的侧链- 120。亮氨酸- 531展览不同的侧链构象当AA的非生产性的和富有成效的绑定模式进行了比较。与COX-1变异这残留的阿拉巴马州,法专业,或者用力推并未造成重大损失的活动或底物亲和力。L531F的决心:AA AA绑定在同一晶体结构导致全球每个单体构象。我们推测,亮氨酸- 531侧链的流动性增加环氧酶的体积可以在开放渠道,有助于观察cox - 2的充氧能力广泛的底物脂肪酸和脂肪酸酯。

DrugBank数据引用了这篇文章

药物靶点

药物	目标	类	生物	药理作用	行动
Icosapent	前列腺素合成酶1 G / H	蛋白质	人类	是的	抑制剂	细节
Icosapent	前列腺素合成酶2 G / H	蛋白质	人类	是的	抑制剂	细节

药物酶

药物	酶	类	生物	药理作用	行动
欧米珈- 3脂肪酸	前列腺素合成酶2 G / H	蛋白质	人类	未知的	底物	细节