ATM和ATR底物分析揭示了广泛的蛋白质网络对DNA损伤的响应。

文章的细节

引用

Matsuoka S, Ballif BA, Smogorzewska A, McDonald ER 3rd, Hurov KE, Luo J, Bakalarski CE, Zhao Z, Solimini N, Lerenthal Y, Shiloh Y, Gygi SP, Elledge SJ

ATM和ATR底物分析揭示了广泛的蛋白质网络对DNA损伤的响应。

科学,2007年5月25日;316(5828):1160-6。

PubMed ID
17525332 (PubMed视图
摘要

细胞对DNA损伤的反应是由一些蛋白激酶介导的,包括ATM(共济失调毛细血管扩张突变)和ATR (ATM和rad3相关)。该途径的信号转导部分的轮廓是已知的,但对DNA损伤反应(DDR)的生理范围知之甚少。我们对ATM和ATR识别的一致位点上响应DNA损伤磷酸化的蛋白质进行了大规模的蛋白质组学分析,并确定了900多个调控磷酸化位点,包括700多个蛋白质。对该数据集子集的功能分析表明,该列表中涉及DDR的蛋白质高度富集。这组蛋白质是高度互联的,我们发现了大量的蛋白质模块和网络,之前没有连接到DDR。该数据库为DDR描绘了比以前更广阔的图景,并为研究哺乳动物对DNA损伤的反应开辟了新的途径。

引用本文的药物库数据

多肽
的名字 UniProt ID
RAF原癌基因丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 P04049 细节
丝氨酸-tRNA连接酶,细胞质 P49591 细节
Abelson酪氨酸蛋白激酶2 P42684 细节
-2肾上腺素能受体 P07550 细节
钠/氢交换器 P19634 细节
环amp响应元件结合蛋白1 P16220 细节
丝裂原活化蛋白激酶14 Q16539 细节
Deoxyhypusine合酶 P49366 细节
微管相关蛋白1A P78559 细节
聚[adp -核糖]聚合酶 P09874 细节
激酶样蛋白KIF11 P52732 细节
热休克蛋白hsp90 - β P08238 细节
肽酰脯氨酸顺反异构酶G Q13427 细节
dna依赖性蛋白激酶催化亚基 P78527 细节
DNA拓扑异构酶2- β Q02880 细节
可能依赖于atp的RNA解旋酶DDX6 P26196 细节
c末端结合蛋白1 Q13363 细节
脱氧胞苷激酶 P27707 细节
细胞肿瘤抗原p53 P04637 细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 O14757 细节
b淋巴细胞抗原CD19 P15391 细节
DNA聚合酶催化亚基A Q07864 细节
DNA聚合酶4亚基 Q9NR33 细节
核受体共激活因子1 Q15788 细节
肽基脯氨酸顺反异构酶 Q13526 细节
热休克同源蛋白71 kDa P11142 细节
CREB-binding蛋白质 Q92793 细节
RNA聚合酶II转录亚基1的中介物 Q15648 细节
过渡内质网atp酶 P55072 细节
驱动蛋白样蛋白KIF2C Q99661 细节
丝氨酸蛋白激酶ATM Q13315 细节
异质核核糖核蛋白F P52597 细节
热休克70 kDa蛋白4 P34932 细节
远上游元件结合蛋白2 Q92945 细节
异染色质蛋白1结合蛋白3 Q5SSJ5 细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶LATS1 O95835 细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶OSR1 O95747 细节
v型质子atp酶116 kDa亚基a亚型2 Q9Y487 细节
真核翻译起始因子4e结合蛋白1 Q13541 细节