ATM和ATR底物分析揭示了广泛的蛋白质网络对DNA损伤的响应。
文章的细节
-
引用
-
Matsuoka S, Ballif BA, Smogorzewska A, McDonald ER 3rd, Hurov KE, Luo J, Bakalarski CE, Zhao Z, Solimini N, Lerenthal Y, Shiloh Y, Gygi SP, Elledge SJ
ATM和ATR底物分析揭示了广泛的蛋白质网络对DNA损伤的响应。
科学,2007年5月25日;316(5828):1160-6。
- PubMed ID
-
17525332 (PubMed视图]
- 摘要
-
细胞对DNA损伤的反应是由一些蛋白激酶介导的,包括ATM(共济失调毛细血管扩张突变)和ATR (ATM和rad3相关)。该途径的信号转导部分的轮廓是已知的,但对DNA损伤反应(DDR)的生理范围知之甚少。我们对ATM和ATR识别的一致位点上响应DNA损伤磷酸化的蛋白质进行了大规模的蛋白质组学分析,并确定了900多个调控磷酸化位点,包括700多个蛋白质。对该数据集子集的功能分析表明,该列表中涉及DDR的蛋白质高度富集。这组蛋白质是高度互联的,我们发现了大量的蛋白质模块和网络,之前没有连接到DDR。该数据库为DDR描绘了比以前更广阔的图景,并为研究哺乳动物对DNA损伤的反应开辟了新的途径。
引用本文的药物库数据
- 多肽
-
的名字 UniProt ID RAF原癌基因丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 P04049 细节 丝氨酸-tRNA连接酶,细胞质 P49591 细节 Abelson酪氨酸蛋白激酶2 P42684 细节 -2肾上腺素能受体 P07550 细节 钠/氢交换器 P19634 细节 环amp响应元件结合蛋白1 P16220 细节 丝裂原活化蛋白激酶14 Q16539 细节 Deoxyhypusine合酶 P49366 细节 微管相关蛋白1A P78559 细节 聚[adp -核糖]聚合酶 P09874 细节 激酶样蛋白KIF11 P52732 细节 热休克蛋白hsp90 - β P08238 细节 肽酰脯氨酸顺反异构酶G Q13427 细节 dna依赖性蛋白激酶催化亚基 P78527 细节 DNA拓扑异构酶2- β Q02880 细节 可能依赖于atp的RNA解旋酶DDX6 P26196 细节 c末端结合蛋白1 Q13363 细节 脱氧胞苷激酶 P27707 细节 细胞肿瘤抗原p53 P04637 细节 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 O14757 细节 b淋巴细胞抗原CD19 P15391 细节 DNA聚合酶催化亚基A Q07864 细节 DNA聚合酶4亚基 Q9NR33 细节 核受体共激活因子1 Q15788 细节 肽基脯氨酸顺反异构酶 Q13526 细节 热休克同源蛋白71 kDa P11142 细节 CREB-binding蛋白质 Q92793 细节 RNA聚合酶II转录亚基1的中介物 Q15648 细节 过渡内质网atp酶 P55072 细节 驱动蛋白样蛋白KIF2C Q99661 细节 丝氨酸蛋白激酶ATM Q13315 细节 异质核核糖核蛋白F P52597 细节 热休克70 kDa蛋白4 P34932 细节 远上游元件结合蛋白2 Q92945 细节 异染色质蛋白1结合蛋白3 Q5SSJ5 细节 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶LATS1 O95835 细节 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶OSR1 O95747 细节 v型质子atp酶116 kDa亚基a亚型2 Q9Y487 细节 真核翻译起始因子4e结合蛋白1 Q13541 细节