结合基于蛋白质的IMAC，基于肽的IMAC和MudPIT进行高效的磷蛋白组学分析。

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Cantin GT, Yi W, Lu B, Park SK, Xu T, Lee JD, Yates JR 3

结合基于蛋白质的IMAC，基于肽的IMAC和MudPIT进行高效的磷蛋白组学分析。

蛋白质组学报，2008年3月;7(3):1346-51。doi: 10.1021 / pr0705441。Epub 2008 1月26日。

PubMed ID

18220336 (PubMed视图

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摘要

固定化金属亲和层析(IMAC)是一种常用的策略，用于从消化的蛋白质混合物中富集磷酸肽。然而，当分析复杂的蛋白质混合物时，这种策略本身是低效的。在这里，我们评估了使用基于蛋白质的IMAC作为基于肽的IMAC之前的预富集步骤的有效性。最终，我们将两种基于imac的富集和MudPIT结合在哺乳动物细胞中表皮生长因子通路的定量磷酸化蛋白质组学分析中，鉴定出4470个独特的磷酸化肽，包含4729个磷酸化位点。

引用本文的药物库数据

多肽

的名字	UniProt ID
RAF原癌基因丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶	P04049	细节
双功能谷氨酸/脯氨酸-tRNA连接酶	P07814	细节
溶质载体家族12个成员2	P55011	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶A-Raf	P10398	细节
乙酰辅酶a羧化酶	Q13085	细节
5'- amp活化蛋白激酶催化亚基α -1	Q13131	细节
DNA拓扑异构酶2- α	P11388	细节
表皮生长因子受体	P00533	细节
CTP合成酶1	P17812	细节
DNA(胞嘧啶-5)甲基转移酶1	P26358	细节
C-X-C趋化因子受体4型	P61073	细节
胰岛素受体底物1	P35568	细节
连环蛋白beta 1	P35222	细节
周期蛋白依赖性激酶1	P06493	细节
磷脂酰丝氨酸合成酶1	P48651	细节
微管相关蛋白2	P11137	细节
cgmp抑制的3'，5'-环磷酸二酯酶B	Q13370	细节
周期蛋白依赖性激酶7	P50613	细节
Retinoblastoma-associated蛋白质	P06400	细节
DNA拓扑异构酶2- β	Q02880	细节
wee1样蛋白激酶	P30291	细节
丝裂原活化蛋白激酶1	Q13233	细节
热休克因子蛋白1	Q00613	细节
不依赖阳离子的甘露糖-6-磷酸受体	P11717	细节
多药耐药相关蛋白7	Q5T3U5	细节
Uracil-DNA糖基化酶	P13051	细节
内着丝粒蛋白	Q9NQS7	细节
蛋白激酶C iota型	P41743	细节
Afadin	P55196	细节
波形蛋白	P08670	细节
[3-甲基-2-氧丁酸脱氢酶[脂酰胺]]激酶，线粒体	O14874	细节
碳酸氢钠共转运体3	Q9Y6M7	细节
丝裂原活化蛋白激酶2	Q9Y2U5	细节
rala结合蛋白1	Q15311	细节
循环amp依赖转录因子ATF-2	P15336	细节
tgf - β活化激酶1和map3k7结合蛋白1	Q15750	细节
异质核核糖核蛋白A2/B1	P22626	细节
剪接因子，富含脯氨酸和谷氨酰胺	P23246	细节
Desmoplakin	P15924	细节
富含半胱氨酸和甘氨酸的蛋白1	P21291	细节
Filamin-A	P21333	细节
Nucleophosmin	P06748	细节
拼接因子1	Q15637	细节
Zyxin	Q15942	细节
剪接因子3B亚基1	O75533	细节
ap2相关蛋白激酶1	Q2M2I8	细节
丝裂原活化蛋白激酶4	O95819	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶MARK1	Q9P0L2	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶MARK2	Q7KZI7	细节
MAP/微管亲和调节激酶	P27448	细节
clip -相关蛋白1	Q7Z460	细节
畸形激酶1	Q8N4C8	细节
磷脂酰肌醇4-激酶β	Q9UBF8	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶N1	Q16512	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶N2	Q16513	细节
组蛋白赖氨酸n -甲基转移酶EZH2	Q15910	细节
肌醇聚磷酸1-磷酸酶	P49441	细节
酪氨酸蛋白磷酸酶非受体12型	Q05209	细节
受体蛋白酪氨酸激酶	Q504U8	细节
小眼相关转录因子	O75030	细节
真核翻译起始因子4e结合蛋白1	Q13541	细节
侏儒相关转录因子2	Q13950	细节
赖氨酸特异性组蛋白去甲基酶1A	O60341	细节
增殖标志蛋白Ki-67	P46013	细节
elav样蛋白1	Q15717	细节