分子进化分析thiamine-diphosphate-dependent酶、转酮醇酶。
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Schenk G, Layfield R,糖果JM, Duggleby RG,尼克松PF
分子进化分析thiamine-diphosphate-dependent酶、转酮醇酶。
J摩尔另一个星球。1997年5月,44 (5):552 - 72。
- PubMed ID
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9115179 (在PubMed]
- 文摘
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转酮醇酶组的成员thiamine-diphosphate-dependent酶从17个不同生物体包括哺乳动物、酵母、细菌和植物被用于系统发育重建。对齐的氨基酸和DNA序列21转酮醇酶酶和一个假定的转酮醇酶揭示了一个高度保守的区域数量和不变的残留酶活性的预测的重要性,基于酵母转酮醇酶的晶体结构。一个特定的序列36残留nucleotide-binding主题有一些相似之处,我们将它指定为转酮醇酶的主题。我们报告进一步证明recP蛋白质来自肺炎链球菌可能转酮醇酶和我们列出一些不变的残留可能参与底物结合。发展史的核苷酸和氨基酸序列通过各种方法显示出传统聚类哺乳动物,植物,和革兰氏阴性细菌转酮醇酶。革兰氏阳性细菌的分支顺序不能可靠地推断。甲醛转酮醇酶(有时称为二羟丙酮合酶)的酵母Hansenula polymorpha似乎同源但paralogous其他哺乳动物的酶酵母转酮醇酶。多个转酮醇酶基因的出现在一些生物体是一致的几个基因的复制。高度的相似功能重要的残留物和相同的动力机制是适用于所有特征转酮醇酶酶和命题是一致的,他们都是来自一个共同的祖先的基因。转酮醇酶似乎是一个古老的酶,这种酶发展缓慢,可能作为模型分子钟,至少在哺乳动物进化枝。