人类10号染色体的DNA序列与比较分析。
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Deloukas P, Earthrowl我,Grafham DV, Rubenfield M,法国L,管家,西姆斯SK,琼斯MC,塞尔年代,斯科特•C豪K,狩猎,安德鲁斯TD,吉尔伯特詹,Swarbreck D,艾舍斯特杰,泰勒,战斗J,鸟CP, Ainscough R,阿尔梅达JP,阿什维尔RI,安布罗斯KD,巴贝奇AK, Bagguley CL,贝利J, Banerjee R,贝茨K,比斯利H, Bray-Allen年代,棕色的AJ,棕色的司法院,Burford特区Burrill W,伯顿J,卡希尔P, Camire D,卡特NP,查普曼JC,克拉克SY,克拉克G, Clee厘米,克莱格,寇比N,库尔森,Dhami P,杜塔,邓恩M,福克纳L,法兰克,弗兰克兰是的,获得P,加内特J,蛀木水虱年代,格里菲斯C, Grocock R, Gustafson E,哈蒙德年代,哈雷杰,哈特E,希思PD,何鸿燊TP,霍普金斯B,霍恩J,豪顿PJ,臀部E, Hynds C, C约翰逊,约翰逊D,假名,凯米,金伯利,Kershaw JK, Kokkinaki M, Laird门将,软件的年代,李嗯,Leongamornlert哒,Laird G,劳埃德·C,劳埃德DM, Loveland J,洛弗尔J,迈凯轮,McLay KE, McMurray, Mashreghi-Mohammadi M,马修斯L,米尔恩年代,Nickerson T,阮M, Overton-Larty E,帕默SA,皮尔斯AV,派克AI, Pelan年代,B·菲利莫尔这样说道,波特K,大米厘米,Rogosin,罗斯•太Sarafidou T, Sehra港元,Shownkeen R, Skuce CD,史密斯M,斯坦德林L,梧桐N,试验机J,索普,Torcasso W,特蕾西,Tromans, Tsolas J,墙,沃尔什J,王H,魏因斯托克K,西美联社Willey DL, Whitehead SL, Wilming L,雷PW,年轻L,陈Y,情人RC, Moschonas NK, Siebert R, Fechtel K,宾利D,杜宾R,哈伯德T, Doucette-Stamm L,贝克,史密斯博士,罗杰斯J
人类10号染色体的DNA序列与比较分析。
自然。2004年5月27日;429(6990):375-81。
- PubMed ID
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15164054 (在PubMed]
- 摘要
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人类10号染色体的最终序列共有131,666,441个碱基对。它代表了99.4%的真色DNA,包括染色体短臂和长臂的近entromeric区域内的异色序列的一个兆酶。序列注释共发现1357个基因,其中蛋白质编码基因816个,伪基因430个。我们观察到重叠编码基因(任一链)的广泛存在,并鉴定出67个反义转录本。我们的分析表明,染色体间和染色体内的分段复制都影响了染色体10上的基因计数。多物种比较分析表明,我们可以利用现有资源对蛋白质编码基因进行注释。我们估计超过95%的编码外显子在这项研究中被识别出来。对人类10号染色体和黑猩猩序列之间单碱基变化的评估显示,与人类序列相比,只有21个编码基因发生了无意义突变。
引用本文的药库数据
- 多肽
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的名字 UniProt ID Sterol-4-alpha-carboxylate 3-dehydrogenase,脱羧基 Q15738 细节 脯氨酰4-羟化酶亚基α -1 P13674 细节 突触囊泡胺转运蛋白 Q05940 细节 醛酮还原酶家族1成员C1 Q04828 细节 beta 1肾上腺素能受体 P08588 细节 谷氨酸脱氢酶1,线粒体 P00367 细节 花生四烯酸5-lipoxygenase P09917 细节 Retinol-binding蛋白3 P10745 细节 胞质嘌呤5核苷酸酶 P49902 细节 Alpha-2A肾上腺素能受体 P08913 细节 Retinol-binding蛋白4 P02753 细节 类固醇17-alpha-hydroxylase / 17日20裂合酶 P05093 细节 s -腺苷甲硫氨酸合成酶亚型1型 Q00266 细节 鸟氨酸转氨酶,线粒体 P04181 细节 蛋氨酸- r -亚砜还原酶B2,线粒体 Q9Y3D2 细节 醛酮还原酶家族1成员C4 P17516 细节 苏氨酸synthase-like 1 Q8IYQ7 细节 胆碱O-acetyltransferase P28329 细节 天冬氨酸转氨酶,胞质 P17174 细节 钙活化钾通道亚基α -1 Q12791 细节 短/支链特异性酰基辅酶a脱氢酶,线粒体 P45954 细节 醛酮还原酶家族1成员C3 P42330 细节 醛酮还原酶家族1成员C2 P52895 细节 5 -羟色胺受体7 P34969 细节 白细胞介素-2受体亚单位 P01589 细节 神经元特异性泡状蛋白calcyon Q9NYX4 细节 NADH脱氢酶[泛素酮]1 β亚复合体8亚基,线粒体 O95169 细节 胰腺三酰甘油脂肪酶 P16233 细节 成纤维细胞生长因子受体2 P21802 细节 谷胱甘肽S-transferaseω₁ P78417 细节 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate合酶 P54886 细节 Urokinase-type纤溶酶原激活物 P00749 细节 Cubilin O60494 细节 管状多特异性有机阴离子转运蛋白 Q92887 细节 细胞周期蛋白依赖性激酶1 P06493 细节 肺表面活性剂相关蛋白D P35247 细节 Hexokinase-1 P19367 细节 Methylated-DNA——protein-cysteine甲基转移酶 P16455 细节 基质细胞衍生因子1 P48061 细节 Prosaposin P07602 细节 降解酶 P14735 细节 蛋白激酶C型 Q04759 细节 肽酰脯氨酰顺反异构酶F,线粒体 P30405 细节 Caspase-7 P55210 细节 Kinesin-like蛋白质KIF11 P52732 细节 Phytanoyl-CoA加双氧酶,过氧化物酶病 O14832 细节 Neuropilin-1 O14786 细节 谷氨酸受体-1 Q9ULK0 细节 谷胱甘肽S-transferase omega-2 Q9H4Y5 细节 电压依赖性的l型钙通道亚基β -2 Q08289 细节 核因子NF-kappa-B p100亚基 Q00653 细节 原癌基因酪氨酸蛋白激酶受体Ret P07949 细节 神经肽Y受体4型 P50391 细节 依赖nadd的蛋白去乙酰化酶sirtuin-1 Q96EB6 细节 电压依赖性阴离子选择通道蛋白2 P45880 细节 缺氧诱导因子1- α抑制剂 Q9NWT6 细节 tRNA(胞嘧啶(38)- c(5))甲基转移酶 O14717 细节 细胞色素P450 2 c9 P11712 细节 细胞色素P450 2 c8 P10632 细节 Pleckstrin同源结构域A家族成员1 Q9HB21 细节 游离脂肪酸受体4 Q5NUL3 细节 DNA损伤诱导转录本4蛋白 Q9NX09 细节 细胞色素P450 26 a1 O43174 细节 细胞色素P450 2 e1 P05181 细节 细胞色素P450 2 c19 P33261 细节 腺苷酸激酶 P55263 细节 受体型酪氨酸蛋白磷酸酶 P23469 细节 整合素beta 1 P05556 细节 细胞色素P450 2 c18 P33260 细节 胃三酰甘油脂肪酶 P07098 细节 矩阵metalloproteinase-21 Q8N119 细节 Glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase 2 O60551 细节 丝裂原激活蛋白激酶 P45983 细节 ATP合酶亚基γ,线粒体 P36542 细节 STE20-like丝氨酸/ threonine-protein激酶 Q9H2G2 细节 Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase 1 Q13907 细节 钙/钙调素依赖性蛋白激酶1D型 Q8IU85 细节 钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶II型亚基γ Q13555 细节 波形蛋白 P08670 细节 Tolloid-like蛋白2 Q9Y6L7 细节 肺表面活性剂相关蛋白A1 Q8IWL2 细节 DNA nucleotidylexotransferase P04053 细节 Enoyl-CoA水合酶、线粒体 P30084 细节 邻苯二酚o甲基转移酶结构域蛋白1 Q86VU5 细节 adp核基化因子样蛋白3 P36405 细节 核因子kappa-B激酶亚基α的抑制剂 O15111 细节 锥cgmp特异性3',5'-环磷酸二酯酶亚基α ' P51160 细节 Hyaluronan-binding蛋白2 Q14520 细节 亚砷酸甲基转移酶 Q9HBK9 细节 肌动蛋白,主动脉平滑肌 P62736 细节 核仁和盘体磷酸蛋白1 Q14978 细节 蛋白质O-GlcNAcase O60502 细节 金属运输车CNNM2 Q9H8M5 细节 多囊肾病2-样1蛋白 Q9P0L9 细节 异质核核糖核蛋白F P52597 细节 细胞色素P450 26 c1 Q6V0L0 细节 α -胰蛋白酶间抑制剂重链H2 P19823 细节 巨噬细胞甘露糖受体1 P22897 细节 Myosin-IIIa Q8NEV4 细节 1, 5-anhydro-D-fructose还原酶 Q96JD6 细节 锌转运体ZIP12 Q504Y0 细节 平衡核苷转运蛋白3 Q9BZD2 细节 增殖标志蛋白Ki-67 P46013 细节