用液相色谱质谱法筛选n -糖基化蛋白。

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邦肯伯格J，皮尔奇BJ，波德捷列尼科夫AV，维斯涅夫斯基JR

用液相色谱质谱法筛选n -糖基化蛋白。

蛋白质组学,2004年2月,4(2):454 - 65。

PubMed ID

14760718 (在PubMed

］

摘要

在过去的几年里，质谱已经成为描述翻译后修饰蛋白的首选方法。大多数蛋白质的化学修饰都是二元的，也就是说，一个特定的残基只有一个变化，而一个糖基化位点残基上可以附着许多不同的寡糖。复杂生物样品中糖蛋白的详细表征是极具挑战性的。然而，n -糖基化的信息可以在中介水平上获得。在这里，我们演示了一种通过降低样品复杂性和增加糖蛋白含量来绘制复杂混合物中n -糖基化位点的程序。糖基化蛋白通过最初的凝集素色谱步骤选择，并用内源性蛋白酶lysc消化。然后通过第二步凝集素色谱从消化混合物中选择糖基化肽。用n-糖苷酶F去除糖聚糖成分，用胰蛋白酶消化肽，然后用在线反相液相色谱质谱法分析。利用刀豆蛋白A和小麦胚芽凝集素这两种不同的凝集素，将该方法应用于人血清，共鉴定出77个蛋白的86个n -糖基化位点。

引用本文的药库数据

多肽

的名字	UniProt ID
凝血酶原	P00734	细节
Corticosteroid-binding球蛋白	P08185	细节
抗凝血酶iii	P01008	细节
转体基因	P02766	细节
Serotransferrin	P02787	细节
Alpha-2-macroglobulin	P01023	细节
Alpha-1-acid糖蛋白1	P02763	细节
血清paraoxonase /芳香酯1	P27169	细节
Alpha-1-antitrypsin	P01009	细节
胰岛素样生长因子结合蛋白3	P17936	细节
Kininogen-1	P01042	细节
血管性血友病因子	P04275	细节
Vitronectin	P04004	细节
血浆铜蓝蛋白	P00450	细节
纤连蛋白	P02751	细节
纤维蛋白原γ链	P02679	细节
血浆丝氨酸蛋白酶抑制剂	P05154	细节
胆碱酯酶	P06276	细节
血浆蛋白酶C1抑制剂	P05155	细节
Beta-2-glycoprotein 1	P02749	细节
Zinc-alpha-2-glycoprotein	P25311	细节
补体C3	P01024	细节
羧肽酶N亚基2	P22792	细节
Alpha-1-acid糖蛋白2	P19652	细节
Ig α -2链C区	P01877	细节
凝血因子十二世	P00748	细节
补充C4-A	P0C0L4	细节
补充C4-B	P0C0L5	细节
载脂蛋白D	P05090	细节
Ig是C链区域	P01871	细节
Afamin	P43652	细节
Alpha-1B-glycoprotein	P04217	细节
Alpha-2-HS-glycoprotein	P02765	细节
c4b结合蛋白α链	P04003	细节
补充成分C9	P02748	细节
补体因子H	P08603	细节
我补充因素	P05156	细节
Clusterin	P10909	细节
富亮氨酸alpha-2-glycoprotein	P02750	细节
Lumican	P51884	细节
c4b结合蛋白β链	P20851	细节
α -胰蛋白酶间抑制剂重链H1	P19827	细节
α -胰蛋白酶间抑制剂重链H4	Q14624	细节
Alpha-1-antichymotrypsin	P01011	细节
载脂蛋白b - 100	P04114	细节
血液结合素	P02790	细节
结合珠蛋白	P00738	细节