精确和大规模的策略核心fucosylated糖蛋白的识别。

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王陆贾W, Z,傅Y,惠普,王LH,气H,元ZF,郑ZB,歌曲LN,韩寒HH,梁YM王莱托,Cai Y,张YK,邓黄,应WT,他钱XH SM

精确和大规模的策略核心fucosylated糖蛋白的识别。

摩尔细胞蛋白质组学,2009;8(5):913 - 23所示。doi: 10.1074 / mcp.M800504-MCP200。Epub 2009年1月12日。

PubMed ID

19139490 (在PubMed

]

文摘

核心fucosylation (CF)模式的糖蛋白更敏感和具体评价各自的总蛋白质含量的诊断许多疾病,如癌症。全球分析和定量表征CF糖蛋白可能揭示临床应用有效的生物标志物。然而,目前的技术无法揭示CF糖蛋白大规模精确。我们开发一个健壮的战略集成分子量截止,中性loss-dependent女士(3),数据库独立候选人频谱过滤,有效识别和优化CF糖蛋白。光谱的基本原理治疗创新基于光谱的质量分布计算的CF糖肤。展示了这种策略的有效性,实现等离子体与肝细胞癌健康受试者和主题。超过100个CF糖蛋白和CF网站,和超过10000发现了CF糖肽的质谱。识别结果显示的规模很大的进步寻找生物标记与一个特定的和有吸引力的前景,和候选人光谱将是一个有用的资源为糖肤数据库搜索方法的改进。必威国际app

DrugBank数据引用了这篇文章

多肽

的名字	UniProt ID
凝血酶原	P00734	细节
1型血管紧张素ⅱ受体	P30556	细节
多巴胺beta-hydroxylase	P09172	细节
电压门控钾通道亚科6 H成员	Q9H252	细节
Serotransferrin	P02787	细节
肝素辅因子2	P05546	细节
谷氨酰胺酶肾脏同种型,线粒体	O94925	细节
Alpha-2-macroglobulin	P01023	细节
Alpha-1-antitrypsin	P01009	细节
胰岛素样生长因子结合蛋白3	P17936	细节
膜伯胺氧化酶	Q16853	细节
E3 ubiquitin-protein连接酶Mdm2	Q00987	细节
Kininogen-1	P01042	细节
血管性血友病因子	P04275	细节
Vitronectin	P04004	细节
细胞间粘附分子1	P05362	细节
血浆铜蓝蛋白	P00450	细节
纤连蛋白	P02751	细节
纤维蛋白原γ链	P02679	细节
Prolow-density脂蛋白受体相关蛋白1	Q07954	细节
胆碱酯酶	P06276	细节
等离子体蛋白酶C1抑制剂	P05155	细节
Ig gamma 1链恒定区	P01857	细节
Beta-2-glycoprotein 1	P02749	细节
Zinc-alpha-2-glycoprotein	P25311	细节
清道夫受体蛋白质M130 cysteine-rich 1型	Q86VB7	细节
Cadherin-5	P33151	细节
胆甾醇酯转运蛋白	P11597	细节
Ig gamma-2链恒定区	P01859	细节
蛋白酶体的β亚基类型4	P28070	细节
Igα2链恒定区	P01877	细节
补充C4-A	P0C0L4	细节
载脂蛋白D	P05090	细节
Ig gamma-4链恒定区	P01861	细节
Ig alpha -链恒定区	P01876	细节
IgμC链	P01871	细节
硒蛋白P	P49908	细节
Afamin	P43652	细节
Alpha-2-HS-glycoprotein	P02765	细节
补充成分C9	P02748	细节
补体因子H	P08603	细节
我补充因素	P05156	细节
Clusterin	P10909	细节
富亮氨酸alpha-2-glycoprotein	P02750	细节
Kallistatin	P29622	细节
色素epithelium-derived因素	P36955	细节
Ficolin-3	O75636	细节
Inter-alpha-trypsin抑制剂重链H1	P19827	细节
免疫球蛋白J链	P01591	细节
disintegrin和金属蛋白酶与血小板反应蛋白图案13	Q76LX8	细节
磷脂转运蛋白	P55058	细节
Prostaglandin-H2 D-isomerase	P41222	细节
血液结合素	P02790	细节
结合珠蛋白	P00738	细节
白细胞介素- 6受体β亚基	P40189	细节
Hyaluronidase-4	Q2M3T9	细节