识别二维凝胶的蛋白质分子量肽片段的蛋白质序列数据库的搜索。必威国际app

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黄Henzel WJ Billeci TM, Stults JT, SC,渡边Grimley C, C

识别二维凝胶的蛋白质分子量肽片段的蛋白质序列数据库的搜索。必威国际app

《美国国家科学院刊S a . 1993年6月1,90 (11):5011 - 5。

PubMed ID
8506346 (在PubMed
]
文摘

快速方法识别已知的由二维凝胶电泳分离蛋白质分子大量的肽片段的描述用于搜索一个蛋白质序列数据库。必威国际app肽是由原位生成减少,烷基化,胰蛋白酶消化的蛋白质electroblotted从二维凝胶。群众决心在subpicomole级别matrix-assisted激光解吸/电离质谱的未消化。科学家发明了一个电脑程序,搜索多个单个蛋白质的肽的蛋白质序列数据库匹配的测量质量。必威国际app确保最新的数据库更新包括理论的消化整个数据库生成程序每次执行。该方法便于同时处理大量二维凝胶点。该方法应用于一个二维凝胶的原油大肠杆菌中提取electroblotted到聚(亚乙烯基二氟化物)膜。10个随机选择的点进行了分析。与三肽质量,每个蛋白质都来自91000多个蛋白质序列的唯一标识。所有标识都验证了并发n端序列相同的地点从第二个污点。 One of the spots contained an N-terminally blocked protein that required enzymatic cleavage, peptide separation, and Edman degradation for confirmation of its identity.

DrugBank数据引用了这篇文章

多肽
的名字 UniProt ID
苹果酸脱氢酶 P61889 细节
尿苷磷酸化酶 P12758 细节
嘌呤核苷磷酸化酶DeoD-type P0ABP8 细节
胞嘧啶核苷脱氨酶 P0ABF6 细节