群体遗传学的大肠杆菌在自然土生土长的澳大利亚人口老鼠。
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群体遗传学的大肠杆菌在自然土生土长的澳大利亚人口老鼠。
环境Microbiol。2000年12月;2 (6):594 - 610。
- PubMed ID
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11214793 (在PubMed]
- 文摘
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大肠杆菌、肠道的正常居住的哺乳动物和鸟类,是一个多样的物种。对大肠杆菌群体大多数研究涉及从人类或human-associated动物有机体。在这项研究中,我们进行了一项调查的大肠杆菌从澳大利亚本土哺乳动物,主要鼠属tunneyi,生活在一个相对原始环境Bundjalung国家公园。茎的遗传多样性评估和比较了酶电泳(MLEE)、mdh(苹果酸酶)基因的序列分析和生物型使用七糖。九十九电泳类型确定了242年的隔离分析MLEE和15个序列来自21个代表菌株mdh基因测序。Bundjalung隔离扩展多样性所代表的大肠杆菌参考(ECOR),与新MLEE等位基因中发现六的位点。许多Bundjalung隔离掉进MLEE离散群。其他Bundjalung大肠杆菌菌株落入公认ECOR设置组,但往往是底部MLEE和mdh基因的树,这意味着这些菌株分别来自祖先的ECOR组和形式ECOR代表只有一个子集的大肠杆菌菌株适应人类和human-associated动物。连锁不平衡分析表明,Bundjalung人口有一个“流行”的人口结构。Bundjalung隔离能够利用更多的糖比ECOR菌株,表明饮食大肠杆菌在适应中起着重要的作用。