利用基因-蛋白质数据库进行大肠杆菌蛋白质组分析。

文章的细节

引用

复制到剪贴板

VanBogelen RA, Abshire KZ, Moldover B, Olson ER, Neidhardt FC

利用基因-蛋白质数据库进行大肠杆菌蛋白质组分析。

电泳。1997 Aug;18(8):1243-51。

PubMed ID

9298644 (PubMed视图

］

摘要

大肠杆菌基因蛋白数据库是一个数据的集合，主要是由二维(2d)聚丙烯酰胺凝胶电泳分离细胞蛋白质的复杂混合物产生的。该数据库目前包含大约1600个蛋白质点。这些数据既包括许多这些蛋白质的鉴定信息，也包括蛋白质水平或合成速率在不同生长条件下如何变化的数据。目前有三个项目正在进行中，以进一步阐明大肠杆菌蛋白质组，包括一个在二维凝胶上定位由大肠杆菌染色体编码的所有开放阅读框的项目，一个确定每个开放阅读框表达的条件的项目，以及一个确定每个蛋白质在细胞中的丰度和位置的项目。讨论了蛋白质组数据库在细胞建模中的应用，并给出了在治疗性药物发现中的应用实例。

引用本文的药物库数据

多肽

的名字	UniProt ID
苹果酸脱氢酶	P61889	细节
D-lactate脱氢酶	P06149	细节
30S核糖体蛋白S9	P0A7X3	细节
30S核糖体蛋白S10	P0A7R5	细节
dna定向RNA聚合酶亚基β	P0A8V2	细节
谷胱甘肽还原酶	P06715	细节
dna定向RNA聚合酶亚单位	P0A7Z4	细节
DNA聚合酶I	P00582	细节
富马酸还原酶黄蛋白亚基	P00363	细节
丙酮酸脱氢酶[泛醌]	P07003	细节
DNA旋回酶亚基B	P0AES6	细节
3-oxoacyl-[酰基载体蛋白]合成酶1	P0A953	细节
天冬氨酸转氨酶	P00509	细节
腺苷酸激酶	P69441	细节
异柠檬酸脱氢酶	P08200	细节
Beta-lactamase	P00811	细节
脱氧尿苷5'-三磷酸核苷酸水解酶	P06968	细节
苷酶	P00722	细节
Thymidylate合酶	P0A884	细节
蛋氨酸,tRNA连接酶	P00959	细节
UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate——2,6-diaminopimelate连接酶	P22188	细节
色氨酸合成蛋白TrpCF	P00909	细节
外膜蛋白F	P02931	细节
甘油激酶	P0A6F3	细节
蛋氨酸合成酶	P13009	细节
dna -3-甲基腺苷糖基化酶	P05100	细节
l -阿拉伯糖结合质周蛋白	P02924	细节
生物素合成酶	P12996	细节
甲酸乙酰转移酶1	P09373	细节
组氨酸,tRNA连接酶	P60906	细节
磷酸烯醇丙酮酸羧化酶	P00864	细节
Diaminopimelate脱羧酶	P00861	细节
鸟氨酸氨甲酰转移酶链I	P04391	细节
Rhamnulose-1-phosphate醛缩酶	P32169	细节
碱性磷酸酶	P00634	细节
富马酸水合酶II类	P05042	细节
核糖导入结合蛋白RbsB	P02925	细节
DNA拓扑异构酶	P06612	细节
麦芽糖结合质周蛋白	P0AEX9	细节
丙酮酸脱氢酶E1组分	P0AFG8	细节
5 ' -methylthioadenosine / S-adenosylhomocysteine核苷酶	P0AF12	细节
二氢叶酸还原酶	P0ABQ4	细节
甲硫氨酸氨肽酶	P0AE18	细节
camp激活的全球转录调节因子CRP	P0ACJ8	细节
Branched-chain-amino-acid转氨酶	P0AB80	细节
可溶性溶木素转糖基酶	P0AGC3	细节
趋化蛋白CheY	P0AE67	细节
AMP核苷酶	P0AE12	细节
酪氨酸- tRNA连接酶	P0AGJ9	细节
阿拉伯糖操纵子调节蛋白	P0A9E0	细节
单链dna结合蛋白	P0AGE0	细节
Amidophosphoribosyltransferase	P0AG16	细节
外膜蛋白A	P0A910	细节
2-氨基-3-酮丁酸辅酶A连接酶	P0AB77	细节
甘油醛-3-磷酸脱氢酶A	P0A9B2	细节
d -半乳糖结合质周蛋白	P0AEE5	细节
d -丙氨酰- d -丙氨酸羧肽酶DacA	P0AEB2	细节
硫氧还蛋白还原酶	P0A9P4	细节
KHG / KDPG醛缩酶	P0A955	细节
DNA聚合酶III亚单位	P03007	细节
乳糖操纵子阻滞剂	P03023	细节
DNA聚合酶III亚单位tau	P06710	细节
Ecotin	P23827	细节
Flavodoxin-1	P61949	细节
谷氨酸脱羧酶	P69908	细节
胱硫醚gamma-synthase	P00935	细节
天冬氨酸氨甲酰转移酶催化亚基	P0A786	细节
琥珀酸脱氢酶黄蛋白亚基	P0AC41	细节
50S核糖体蛋白L4	P60723	细节
dna定向RNA聚合酶亚基β '	P0A8T7	细节
DNA聚合酶III亚基β	P0A988	细节
富马酸还原酶铁硫亚基	P0AC47	细节
atp依赖性Clp蛋白酶的蛋白水解亚基	P0A6G7	细节
3-hydroxydecanoyl -酰基载体蛋白质脱水酶	P0A6Q3	细节
Methionyl-tRNA formyltransferase	P23882	细节
大肠杆菌素I受体	P17315	细节
硫醇:二硫交换蛋白DsbA	P0AEG4	细节
30S核糖体蛋白S8	P0A7W7	细节
DNA旋回酶亚单位A	P0AES4	细节
外膜孔	P06996	细节
UvrABC系统蛋白A	P0A698	细节
冷休克蛋白CspA	P0A9X9	细节
蛋白质RecA	P0A7G6	细节