结构分析的苹果酸酶活性部位的变量。
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贝尔JK Yennawar惠普,赖特SK,汤普森JR,中提琴再保险公司Banaszak LJ
结构分析的苹果酸酶活性部位的变量。
J生物化学杂志。2001年8月17日,276 (33):31156 - 62。Epub 2001 6月1。
- PubMed ID
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11389141 (在PubMed]
- 文摘
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苹果酸脱氢酶特别氧化酸盐草酰乙酸。特异性来自三个精氨酸的活性部位的口袋协调稳定和羧基组底物在催化新形成的羟基/酮组。这里,arg - 153的作用底物特异性是由突变R153C检查的区别。NAD二进制的x射线结构复杂2.1揭示了两个硫酸盐离子绑定的封闭形式的活性部位。硫酸,占据了底物结合位点已被翻译大约2活性部位的开放腔。其新位置表明低催化营业额观察R153C变异可能是由于错位的衬底的羟基或酮组与适当的催化残基。在河畔。丙酮酸盐三元复杂,元羧酸抑制剂必然开放构型的活性部位。丙酮酸是协调而不是活跃的站点精氨酸,但是通过弱氢键酰胺骨干。能量最小化的类似物的分子模型R153C(赖特,s·K。中提琴,r . e .(2001)生物。 Chem. 276, 31151-31155) reveal that the regenerated amino and amido side chains can form favorable hydrogen-bonding interactions with the substrate, although a return to native enzymatic activity is not observed. The low activity of the modified R153C enzymes suggests that precise positioning of the guanidino side chain is essential for optimal orientation of the substrate.