体细胞基因序列改变21选择乳房癌的表达谱分析。
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Chanock SJ Burdett L·伊格尔M, Llaca V, Langerod, Presswalla年代,Kaaresen R, Strausberg RL, Gerhard DS, Kristensen V, Perou厘米,Borresen-Dale
体细胞基因序列改变21选择乳房癌的表达谱分析。
乳腺癌研究》2007;9 (1):R5。
- PubMed ID
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17224074 (在PubMed]
- 文摘
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简介:基因组改变乳房癌已观察到影响细胞调节扩散的能力,信号和转移。Re-sequence基于之前的研究调查了候选基因遗传观察遗传不稳定性(拷贝数的变化或地区)或其他实验室观察和定义了关键的体细胞突变基因TP53、PIK3CA等。方法:我们已经扩展了范式21基因主要是通过表达分析识别和分析研究,为乳腺癌亚型分类和预后是有用的。本研究进行了双向re-sequence分析所有外显子和5 ' 3 ',并且在进化上是保守的地区(91年跨越超过16 megabases)乳腺肿瘤样本。结果:八十七独特的躯体变化被发现在16个基因。七十八个碱基对的改变,其中23个错义突变;55是分布在守恒intronic地区或5’和3’区域。有九个插入/删除。因为没有先验的方法来预测是否有一个确定的同义和非编码体细胞变化干扰功能,分析每个基因所特有的需要确定它是一个肿瘤抑制基因,还是没有效果。在五个基因,没有观察到体细胞变化。 CONCLUSION: The study confirms the value of re-sequence analysis in cancer gene discovery and underscores the importance of characterizing somatic alterations across genes that are related not only by function, or functional pathways, but also based upon expression patterns.