构建大肠埃希菌-K12基因组连续874 kb序列，对应于连接图上的50.0-68.8 min，并分析其序列特征。

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山本Y, Aiba H, Baba T, Hayashi K, Inada T, Isono K, Itoh T，木村S，北川M，牧野K，三木T，三桥N, Mizobuchi K，森H，中德S，中村Y, Nashimoto H，大岛T，大山S，斋藤N，三培G，佐藤Y, Sivasundaram S，田上H，堀内T，等。

构建大肠埃希菌-K12基因组连续874 kb序列，对应于连接图上的50.0-68.8 min，并分析其序列特征。

DNA res 1997 april 28;4(2):91-113。

PubMed ID

9205837 (PubMed视图

］

摘要

通过对大肠埃希菌K-12 (W3110)遗传图谱中50.0-68.8 min区域(360 kb)和57.9-68.8 min区域(2个大间隙(共100 kb)和5个短间隙(5个短间隙)DNA序列的测定，构建了对应于该区域500.0 -68.8 min区域的连续874.423碱基对序列。我们分析了其序列特征，发现该区域包含至少894个潜在开放阅读框(orf)，其中346个(38.7%)为既往报道，158个(17.7%)与其他已知基因同源，232个(26.0%)与数据库中登记的假设基因相同或相似，其余158个(17.7%)与其他基因无显著相似性。orf的同源性搜索也发必威国际app现了几个新的基因簇。这些基因包括两个毛状基因簇，线粒体膜中编码人类长链脂肪酸降解酶复合物同源物的三个基因簇，至少9个基因簇参与乙醇胺的利用，11个参与甲酸氢解酶反应的hyc次级基因簇，以及恶臭假单胞菌芳香烃降解酶同源物编码的5个基因簇。我们还发现了多种新基因，包括两个orf，它们与果蝇中的黄嘌呤脱氢酶编码基因和大鼠、小鼠和线虫中负责轴突引导和生长的蛋白质同源。在60.0 min时还新鉴定出一个异亮氨酸tRNA基因，命名为ileY。

引用本文的药物库数据

多肽

的名字	UniProt ID
双功能蛋白FolC	P08192	细节
3-oxoacyl-[酰基载体蛋白]合成酶1	P0A953	细节
Phosphoribosylglycinamide formyltransferase	P08179	细节
4-氨基丁酸转氨酶	P22256	细节
嘌呤核苷磷酸化酶	P45563	细节
膜结合溶髓蛋白转糖基酶B	P41052	细节
长链脂肪酸运输蛋白	P10384	细节
谷氨酸,半胱氨酸连接酶	P0A6W9	细节
双功能多粘菌素抗性蛋白ArnA	P77398	细节
组氨酸,tRNA连接酶	P60906	细节
青霉素不敏感穆林内肽酶	P0C0T5	细节
Glucarate脱水酶	P0AES2	细节
Amidophosphoribosyltransferase	P0AG16	细节
甘氨酸甜菜碱结合质周蛋白	P0AFM2	细节
GMP合成酶[谷氨酰胺水解]	P04079	细节
o-succinylbenzoate合酶	P29208	细节
葡糖激酶	P0A6V8	细节
漆酶域蛋白YfiH	P33644	细节
3-mercaptopyruvate sulfurtransferase	P31142	细节
Flavohemoprotein	P24232	细节
二磷酸核糖核苷还原酶1亚基β	P69924	细节
青霉素结合蛋白1C	P76577	细节
细胞分裂蛋白ZipA	P77173	细节
p蛋白质	P0A9J8	细节
DNA旋回酶亚单位A	P0AES4	细节
蛋白质RecA	P0A7G6	细节