tRNA中心折叠的核糖体邻近区:位于A、P或E位点的tRNA 47位的交联。
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奥斯华，T多林，R布里玛科姆
tRNA中心折叠的核糖体邻近区:位于A、P或E位点的tRNA 47位的交联。
核酸研究，1995 11月25日;23(22):4635-41。
- PubMed ID
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8524654 (PubMed视图］
- 摘要
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来自大肠杆菌的tRNA(Phe) 47位的天然核苷酸3-(3-氨基-3-羧基-丙基)尿苷(acp3U)被二氮嘧啶衍生物修饰，并在核糖体a、P或E位点特定的条件下，在合适的mRNA类似物的存在下与核糖体结合。在350 nm光激活后，通过我们的标准程序鉴定了与核糖体蛋白和RNA的交联。30S亚基蛋白S19(以及弱S9和S13)是A位点tRNA交联的目标，P位点的S7、S9和S13和E位点的S7交联的目标。类似地，在50S亚基中，L16和L27与A位点交联，L1、L5、L16、L27和L33与P位点交联，L1和L33与E位点交联。rRNA相应的交联通过RNase H酶切定位到以下区域:在16S rRNA中，P和E位点的687和727位点之间，1318和1350位点(P位点)和1350和1387位点(E位点);在23S rRNA的865和910位之间，从A位点，1845和1892 (P位点)，1892和1945 (A位点)，2282和2358 (P位点)，2242和2461 (P和E位点)，2461和2488 (A位点)，2488和2539(所有三个位点)和2572和2603 (A和P位点)。在大多数(但不是全部)情况下，通过引物扩展分析可以更精确地定位交联位点。