胰蛋白酶消化泛素标准揭示了一种改进策略识别ubiquitinated蛋白质的质谱分析。
文章的细节
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引用
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丹尼斯•NJ Vasilescu J,兰伯特JP,史密斯JC, Figeys D
胰蛋白酶消化泛素标准揭示了一种改进策略识别ubiquitinated蛋白质的质谱分析。
蛋白质组学,2007年3月,7 (6):868 - 74。
- PubMed ID
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17370265 (在PubMed]
- 文摘
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泛素化中扮演着重要的角色在维持细胞内稳态调节的基本流程。能够识别ubiquitinated蛋白质由女士目前依赖的战略ubiquitinated肽由114.1 Da diglycine赖氨酸残基(GG)标签,这是来自泛素的糖基,胰蛋白酶消化。在接下来的研究中,我们报告一个更全面的方法来映射泛素化网站通过胰蛋白酶消化和MS / MS分析。我们表明,泛素化网站可以通过签名确认多肽含有GG-tag (114.1 Da)和一个LRGG-tag (383.2 Da)内部赖氨酸残留物以及GG-tag发现ubiquitinated糖基的肽。应用这种MS-based方法启用96泛素化网站的识别从人类MCF-7乳腺癌细胞蛋白质纯化,代表增加2.4倍的泛素化网站的数量可以被识别的标准方法。我们改进MS-based策略将帮助未来的研究旨在识别和/或描述ubiquitinated蛋白质在人类细胞。