在CD34+造血干/祖细胞中表达的300个以前未定义基因的cdna的克隆和功能分析

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张广昌，叶敏，吴晓霞，任世祥，赵敏，赵佳杰，付刚，沈勇，范友友，卢刚，钟敏，徐晓荣，韩志刚，张建文，陶杰，黄广昌，周杰，胡广霞，顾杰，陈世杰，陈震

在CD34+造血干/祖细胞中表达的300个以前未定义基因的cdna的克隆和功能分析

基因组学报2000年10月;10(10):1546-60。

PubMed ID

11042152 (PubMed视图

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摘要

基于EST编目、克隆测序、硅克隆和cDNA末端快速扩增(RACE)，从CD34+造血干/祖细胞(HSPCs)中获得了300个包含先前未定义基因的假定完整的开放阅读框(orf)的cDNA。cDNA大小为360 ~ 3496 bp，其orf编码58 ~ 752个氨基酸的多肽。公共数据库搜索表明，225个cd必威国际appna显示出与在各种物种中鉴定的基因的序列相似性。同源性分析在这些cdna中识别出50个基本结构基序/结构域。通过cDNA数据与基因组序列信息的整合，可以在243个基因中建立基因组外显子-内含子组织。有趣的是，在3p上发现了一个名为HSPC070的新基因，在3' UTR上与RAF基因在逆转录方向上共享105bp的序列。使用电子作图对192个基因进行了染色体定位，使用辐射杂交(RH)对38个基因进行了染色体定位。应用Macroarray技术对5种造血细胞系(NB4、HL60、U937、K562和Jurkat)的基因表达模式进行了筛选，发现了大量差异表达的基因。这些资源工作不仅为表达基因组学和基因组DNA序列注释提供了广泛的信息，而且为进一步研究参与造血发育和分化的基因的功能提供了有用的信息。必威国际app

引用本文的药物库数据

多肽

的名字	UniProt ID
NADH脱氢酶[泛醌]1亚基C2	O95298	细节
NADH脱氢酶[泛醌]1 β亚复合物亚基10	O96000	细节
蛋氨酸- r -亚砜还原酶B1	Q9NZV6	细节
NADH脱氢酶[泛醌]1 β亚复合物亚基6	O95139	细节
NADH脱氢酶[泛醌]1 α亚复合体亚基7	O95182	细节
NADH脱氢酶[泛醌]1 β亚复合体亚基2，线粒体	O95178	细节
NADH脱氢酶[泛醌]1 α亚复合体亚基2	O43678	细节
苯丙氨酸-tRNA连接酶β亚基	Q9NSD9	细节
NADH脱氢酶[泛醌]1 β亚复合物亚基9	Q9Y6M9	细节
N(G)，N(G)-二甲基精氨酸二甲胺水解酶	O95865	细节
NADH脱氢酶[泛醌]1 β亚复合体亚基8，线粒体	O95169	细节
5'- amp活化蛋白激酶催化亚基α -1	Q13131	细节
NADH脱氢酶[泛醌]1 α亚复合物亚基3	O95167	细节
谷胱甘肽s转移酶1	Q9Y2Q3	细节
m7GpppX diphosphatase	Q96C86	细节
磷酸酪氨酸和3-磷酸酪氨酸和3-磷酸肌醇的双适配器	Q9UN19	细节
谷氨酰胺- trna (Gln)酰胺转移酶亚基B，线粒体	O75879	细节
60S核糖体亚单位生物发生蛋白NIP7同源物	Q9Y221	细节
60S核糖体蛋白l26样1	Q9UNX3	细节
细胞色素b-c1复合物亚基9	Q9UDW1	细节
蛋白酶体亚单位α -7型	O14818	细节
转运蛋白粒子复合亚基4	Q9Y296	细节
二ph氨酸甲酯合成酶	Q9H2P9	细节
trna -剪接连接酶RtcB同源物	Q9Y3I0	细节
gtp结合核蛋白Ran	P62826	细节
Alpha-hemoglobin-stabilizing蛋白质	Q9NZD4	细节
ATP合酶亚基g，线粒体	O75964	细节