人类Nedd4-1 WW3的结构和动力学与alphaENaC PY基序。
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Bobby R, Medini K, Neudecker P, Lee TV, Brimble MA, McDonald FJ, Lott JS, Dingley AJ
人类Nedd4-1 WW3的结构和动力学与alphaENaC PY基序。
生物化学学报，2013年8月;1834(8):1632-41。doi: 10.1016 / j.bbapap.2013.04.031。Epub 2013 5月8日。
- PubMed ID
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23665454 (PubMed视图］
- 摘要
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Nedd4-1(神经元前体细胞表达发育下调基因4-1)是一种E3泛素连接酶，与上皮Na(+)通道(ENaC)相互作用并负调控。Nedd4-1的WW结构域通过识别PY基序与ENaC亚基结合。Human Nedd4-1 (hNedd4-1)包含四个WW结构域，其中第三个结构域(WW3*)与PY基序的亲和力最强。为了了解这种结合亲和力的机制，我们对hNedd4-1 WW3*结构域与人ENaC α -亚基c端尾部的肽进行了核磁共振结构和动力学分析。该结构揭示了该肽以类似于其他WW结构域- enac肽结构的方式相互作用。与类似的复合物相比，可能提供结合亲和力的关键相互作用是宽阔的XP槽促进了WW3*结构域与肽之间的额外接触，以及R430 (WW3*)和L647' (alphaENaC)之间的大表面积(83A(2))。这证实了(15)N骨架弛豫数据的无模型分析，表明R430是区域内最刚性的残基(S(2)=0.90+/-0.01)。Carr-Purcell-Meiboom-Gill弛豫色散分析在musms时间尺度上确定了两种不同的构象交换过程。其中一个过程涉及位于肽结合界面的残基，这表明构象交换可能在肽识别中发挥作用。因此，复合物的结构和动力学特征似乎都定义了高结合亲和力。 The results should aid interpretation of biochemical data and modeling interfaces between Nedd4-1 and other interacting proteins.