蛋白质组学分析ubiquitinated蛋白质在正常肝细胞细胞系Chang肝细胞。

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王陆Tan F, L, Cai Y, J,谢Y,王L,龚Y,徐,吴J,罗Y,羌族B,彭元J,太阳X, X

蛋白质组学分析ubiquitinated蛋白质在正常肝细胞细胞系Chang肝细胞。

蛋白质组学,2008年7月,8 (14):2885 - 96。doi: 10.1002 / pmic.200700887。

PubMed ID
18655026 (在PubMed
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文摘

翻译修饰的泛素(乌兰巴托)和Ub-like修饰词是最重要的一个机制在真核生物调节多种细胞过程。通过中介26 s的蛋白酶体依赖降解基质,由多个乌兰巴托蛋白质的共价修饰(泛素化)可以调节转录等许多不同的细胞功能,抗原加工、信号转导和细胞周期。为了更好地理解泛素化及其功能,蛋白质组学方法已经开发净化和识别更多的蛋白质基质。26 s蛋白酶体的S5a亚基结合poly-Ub链含有四种或四种以上乌兰巴托。在这项研究中,固定化GST-S5a融合蛋白用于affinity-purify ubiquitinated蛋白常肝细胞。纯化蛋白被发现与多维LC结合MS / MS。八十三潜在的泛素化基质被确定。从这些蛋白质,19个潜在的泛素化网站17日确定潜在的基质。这些潜在的泛素化基质主要是相关重要的细胞功能包括新陈代谢,翻译和转录。我们的研究结果提供有用的信息,进一步了解泛素化机械之间的关系和不同的细胞功能。

DrugBank数据引用了这篇文章

多肽
的名字 UniProt ID
DNA连接酶1 P18858 细节
甲状腺激素受体α P10827 细节
细胞周期蛋白依赖性激酶1 P06493 细节
组蛋白脱乙酰酶3 O15379 细节
高迁移率蛋白B1组 P09429 细节
电压门控钾通道亚科5 H成员 Q8NCM2 细节