人类纤溶酶原kringle物的晶体和分子结构4精制为1.9 a分辨率。
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Mulichak, Tulinsky, Ravichandran公斤
人类纤溶酶原kringle物的晶体和分子结构4精制为1.9 a分辨率。
生物化学。1991年10月29日,30日(43):10576 - 88。
- PubMed ID
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1657148 (在PubMed]
- 文摘
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人纤溶酶原kringle物4的晶体结构(PGK4)解决分子替换使用牛凝血酶原kringle 1 (PTK1)结构模型通过约束最小二乘方法和改进的R因子为1.9 a分辨率14.2%。PTK1 K4结构相似,和残留的插入位置59后者对蛋白质折叠的影响甚微。PGK4结构是高度稳定的,一个内部疏水核心和一个广泛的氢键网络。这kringle包括新特性在Pro30顺式肽键和两个备用,垂直,同样占领Cys75支链的取向。K4 lysine-binding网站由一个疏水槽由Trp62和Trp72吲哚环,与阴离子(Asp55 / Asp57)和阳离子电荷(Lys35 / Arg71)对两端。与相邻Asp5 Arg32残留,这些导致三重带电阴离子和阳离子集群(晶体的pH值6.0),,除了Trp72侧链的异常高的可访问性,作为一个明显的K4表面结合位点的标记。发生复杂的分子间相互作用结合位点之间的symmetry-related硫酸涉及高度有序的分子离子的溶剂化作用Arg32侧链的邻近kringle占据了结合位点。