晶体结构的重组kringle 1域人纤溶酶原与配体配合物物epsilon-aminocaproic酸和trans-4 -(氨甲基)cyclohexane-1-carboxylic酸。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
马修斯二世,Vanderhoff-Hanaver P Castellino FJ Tulinsky
晶体结构的重组kringle 1域人纤溶酶原与配体配合物物epsilon-aminocaproic酸和trans-4 -(氨甲基)cyclohexane-1-carboxylic酸。
生物化学。1996年2月27日,35 (8):2567 - 76。
- PubMed ID
-
8611560 (在PubMed]
- 文摘
-
x射线晶体结构的复合物重组kringle 1域人纤溶酶原(Klpg)物配体epsilon-aminocaproic酸(EACA)和trans-4 -(氨甲基)cyclohexane-1-carboxylic酸(AMCHA),代表一个类的体内纤溶药物,已经确定为2.1埃分辨率。每个Klpg /配体单元单元包含一个二聚体复合物,和一些小差异被发现在kringle /配位原子间的距离在单体的二聚体的组件。获得的结构允许预测的氨基酸残基的Klpg可能重要的配体结合。在晶体结构中,阴离子Klpg中心负责协调的氨基配体是由Asp54和Asp56和稳定的阳离子中心绑定的羧酸盐配体的一部分是Arg70, Arg34的可能贡献。的羧酸盐配体之间的氢键的羟基Tyr63似乎也有助于kringle /配体结合能。亚甲基组配体的稳流绑定口袋里的范德华接触侧链原子Trp61 Tyr71。这些结论与定点诱变结果一般协议涉及到许多相同的氨基酸残基在绑定过程中,从而表明晶体和解决方案结构基本符合。进一步比较Klpg / x射线晶体结构的配体复合物与彼此和apo-Klpg Klpg侧链的几何图形显示,而小差异可能存在的三个结构,结合口袋可以被认为是预制apokringle和不显著改变omega-amino酸配体的性质是插入到网站。相似的几何图形的绑定EACA AMCHA,看来今敏是一个重要的组件的更严格的约束力AMCHA Klpg, EACA相比。命令绑定AMCHA溶解的影响可能导致对Klpg的长寿命,从而阻碍koff,从而影响占较高的结合能AMCHA EACA相比。