epsilon-aminohexanoic酸的溶液结构复杂的人类的纤溶酶原kringle物1。
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Rejante先生,Llinas M
epsilon-aminohexanoic酸的溶液结构复杂的人类的纤溶酶原kringle物1。
221年5月1;欧元。1994 (3):939 - 49。
- PubMed ID
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8181476 (在PubMed]
- 文摘
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人纤溶酶原kringle物1的解决方案结构域复杂纤溶药物6-aminohexanoic酸(εAhx)的基础上获得了1 h - nmr光谱数据和动态模拟退火的计算。两套结构派生从随机线圈构象(a)和(b)(突变)晶体结构的同源凝血酶原kringle 1。两组显示本质上相同的骨干折叠(成对均方根偏差,0.15海里)表明,无论初始结构,数据就足以定位本质上是一个独特的能量最低构象对应。残留的构象与势函数局部大力拉马钱德兰首选区域的地图。Pro30肽债券提出了cis。配体结合位点的kringle 1是一个浅腔由Pro33, Phe36, Trp62, Tyr64, Tyr72 Tyr74。双阴离子和阳离子侧链的中心配置Asp55 Asp57, Arg34 Arg71,分别为锚定的两性离子εAhx分子结合位点。配体展品更紧密的接触kringle阴离子中心(大约0.35海里平均啊……H之间的距离Asp55 / Asp57羧酸盐和配体氨基酸组)与阳离子的(大约0.52海里最亲密的啊……H羧基配体之间的距离和Arg34 / Arg71胍基组)。εAhx烃链建立两侧Pro33, Tyr64, Tyr72 Tyr74一边Phe36。 Dipolar (Overhauser) connectivities indicate that the ligand aliphatic moiety establishes close contacts with the Phe36 and Trp62 aromatic rings. The computed structure suggests that the epsilon Ahx molecule adopts a kinked conformation when complexed to kringle 1, effectively shortening its dipole length to approximately 0.65 nm.