人凝血因子Xa化学抑制的结构基础。

文章的细节

引用

Kamata K, Kawamoto H,本间T,岩间T,金SH

人凝血因子Xa化学抑制的结构基础。

中国科学院学报(自然科学版)1998年6月9日;95(12):6630-5。

PubMed ID
9618463 (PubMed视图
摘要

Xa因子是凝血酶原转化为凝血酶的酶,已成为血栓栓塞性疾病药物发现的替代(凝血酶)靶点。我们合成了一种抑制剂,并通过结晶学方法测定了Des[1-44] Xa因子与抑制剂之间的络合物的晶体结构,其晶体形式为2.3-和2.4-A分辨率。抑制剂FX-2212, (2RS)-(3'-氨基-3-联苯基)-5-(4-吡啶氨基)戊酸的消旋混合物,在体外272 nM抑制50%的Xa因子活性。FX-2212的s异构体(FX-2212a)在两种晶体形式中都与Xa因子的活性位点结合。FX-2212a的联苯胺占据s1 -口袋,吡啶环与Xa因子芳基结合位点发生疏水作用。一些水分子与活性部位的残基结合。与Xa因子的早期晶体结构(如apo-Des[1-45] Xa因子和Des[1-44] Xa因子与萘抑制剂DX-9065a的复合物)相比,Xa因子的两个表皮生长因子样结构域在我们的晶体形式以及两个结构域之间的区域中都是有序的,最近发现这两个结构域是效应细胞蛋白酶受体-1的结合位点。该结构为设计下一代Xa因子抑制剂提供了基础。

引用本文的药物库数据

多肽
的名字 UniProt ID
凝血因子X P00742 细节