RNA监测的一个不被重视的作用。

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Hillman RT, Green RE, Brenner SE

RNA监测的一个不被重视的作用。

中国生物医学工程学报，2004;5(2):R8。Epub 2004年2月2日。

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14759258 (PubMed视图

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摘要

背景:无意义介导的mRNA衰变(Nonsense-mediated mRNA decay, NMD)是一种真核生物mRNA监测机制，可以检测和降解带有过早终止密码子(PTC+ mRNA)的mRNA。在哺乳动物中，如果终止密码子位于最终内含子位置上游约50个核苷酸以上，则该终止密码子被认为是早熟的。人类中超过三分之一的可靠推断的替代剪接事件已被证明会导致PTC+ mRNA异构体。由于NMD的机制细节最近才被阐明，我们假设许多PTC+亚型可能已经被克隆、表征并保存在公共数据库中，即使它们将成为体内降解的目标。结果:我们分析了SWISS-PROT数据库中描述的人类替代蛋白异构体，发现在107个(1363个)SWISS-PROT条目中，有144个(2483个中的5.8%)可分析的异构体序列来自PTC+ mRNA。结论:对于我们鉴定的几种PTC+亚型，现有的实验证据可以重新解释，并且与NMD降解转录本的作用一致。我们鉴定的几个具有mRNA异构体的基因，如PTC+- calpain-10、cdc样激酶(CLKs)和LARD，显示了如何从NMD的角度理解先前的实验结果。

引用本文的药物库数据

多肽

名字	UniProt ID
γ -氨基丁酸B型受体亚基1	Q9UBS5	细节
叶酸受体	P41439	细节
钠钾转运atp酶亚基α -1	P05023	细节
雌激素受体	Q92731	细节
Formimidoyltransferase-cyclodeaminase	O95954	细节
谷氨酰胺酶肾亚型，线粒体	O94925	细节
钾电压门控通道亚家族KQT成员2	O43526	细节
心房利钠肽受体2	P20594	细节
管状多特异性有机阴离子转运体2	O15438	细节
组织型纤溶酶原激活剂	P00750	细节
camp特异性3'，5'-环磷酸二酯酶4A	P27815	细节
双特异性蛋白激酶CLK1	P49759	细节
肿瘤坏死因子受体超家族成员10B	O14763	细节
炭疽毒素受体1	Q9H6X2	细节
Caspase-8	Q14790	细节
微管相关蛋白4	P27816	细节
组蛋白脱乙酰酶10	Q969S8	细节
细胞色素P450 3A43	Q9HB55	细节
蛋白酶体亚单位α -7型	O14818	细节
双特异性蛋白激酶CLK3	P49761	细节
酪蛋白激酶I亚型γ -1	Q9HCP0	细节
LIM结构域激酶1	P53667	细节
循环amp依赖转录因子ATF-3	P18847	细节
adp核糖环化酶/环状adp核糖水解酶	P28907	细节
淋巴增强剂结合因子1	Q9UJU2	细节
双特异性蛋白激酶CLK2	P49760	细节