结构的三个类我人类酒精脱氢酶和同工酶特定的甲酰胺抑制剂。
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引用
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吉本斯BJ,赫尔利道明
结构的三个类我人类酒精脱氢酶和同工酶特定的甲酰胺抑制剂。
生物化学。2004年10月5日,43 (39):12555 - 62。
- PubMed ID
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15449945 (在PubMed]
- 文摘
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甲酰胺是醛类,演示了强有力的和人类酒精脱氢酶同功酶的选择性抑制作用。alphaalpha,β(1)β(1)γ(2)γ(2),sigmasigma亚型都发现强烈抑制甲酰胺代替。本文的结构alphaalpha同种型人类酒精脱氢酶包裹着N-cyclopentyl-N-cyclobutylformamide分辨率2.5是由x射线晶体学,β(1)β(1)同种型人类酒精脱氢酶包裹着N-benzylformamide N-heptylformamide决心1.6和1.65分辨率,分别和γ(2)γ的结构(2)同种型包裹着N-1-methylheptylformamide决心1.45决议。这些结构提供当地的第一作用物水平视图结构差异引起的个人偏好衬底显示这些高度相关的同功酶。与以前的工作相一致,抑制剂的羰基氧与催化锌直接交互的羟基Thr48 (Ser48γ(2)γ(2))的酶。N-benzylformamide的苯环和N-heptylformamide的碳链和N-1-methylheptylformamide与疏水性底物的口袋的大小和形状是由残留交往β(1)β(1)和γ(2)γ(2)同功酶。特别是对丝氨酸对苏氨酸的交换位置48和交换Val的低浓缩铀在141位置γ(2)γ(2)同工酶创造一个环境与立体选择性的R-enantiomer支N-1-methylheptylformamide同工酶抑制剂。的主要特性alphaalpha同种型的Ala Phe93交流扩大催化锌和附近的活性部位创建分支N-cyclopentyl-N-cyclobutylformamide的特异性抑制剂,它显示了这种独特的同工酶的选择性最大的甲酰胺抑制剂。