在正常人表皮角质形成细胞的二维凝胶蛋白数据库中记录的145个蛋白质的微序列。
文章的细节
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引用
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Rasmussen HH, van Damme J, Puype M, Gesser B, Celis JE, Vandekerckhove J
在正常人表皮角质形成细胞的二维凝胶蛋白数据库中记录的145个蛋白质的微序列。
电泳。1992 Dec;13(12):960-9。
- PubMed ID
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1286667 (PubMed视图]
- 摘要
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从二维(2-D)凝胶中恢复的蛋白质的微测序正被系统地用于识别人类角质形成细胞2-D凝胶数据库中的蛋白质。迄今为止,已经对人类2-D凝胶数据库中记录的约250个蛋白质点进行了微测序,其中145个记录在角质形成细胞数据库的入口部分氨基酸序列下。考马斯亮蓝染色蛋白斑点从几个(多达40个)干凝胶中切割,通过洗脱-浓度凝胶电泳浓缩,电印迹到PVDF膜上,用胰蛋白酶原位消化。采用反相高效液相色谱法分离洗脱肽,分别收集并测序。使用Genetic必威国际apps Computer Group的FASTA和TFASTA程序进行计算机搜索表明,110个微测序多肽与PIR、Mipsx或GenEMBL数据库中包含的蛋白质具有显著的相似性。只有35个多肽与迄今为止未知的蛋白质相对应。所有145种蛋白质的肽序列连同它们的坐标(表观分子量和pI)一起列在角质形成细胞数据库中。
引用本文的药物库数据
- 多肽
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的名字 UniProt ID 色氨酸——tRNA连接酶,细胞质 P23381 细节 纤溶酶原激活物抑制剂2 P05120 细节 Calnexin P27824 细节 双功能嘌呤生物合成蛋白PURH P31939 细节 Peroxiredoxin-2 P32119 细节 脂肪酸结合蛋白,表皮 Q01469 细节 Calreticulin P27797 细节 肽酰脯氨酸顺反异构酶B P23284 细节 2型蛋白酶体亚基 P49721 细节 蛋白质S100-A11 P31949 细节 蛋白质S100-A2 P29034 细节 蛋白质S100-A7 P31151 细节 热休克同源蛋白71 kDa P11142 细节 蛋白酶体亚单位α -5型 P28066 细节 蛋白酶体亚单位β -3型 P49720 细节 蛋白酶体亚基-4型 P28070 细节 泛素羧基末端水解酶同工酶L1 P09936 细节 Sorcin P30626 细节 翻译控制肿瘤蛋白 P13693 细节 蛋白质S100-A8 P05109 细节 异质核核糖核蛋白H P31943 细节 异质核核糖核蛋白H3 P31942 细节 异质核核糖核蛋白L P14866 细节 Stress-induced-phosphoprotein 1 P31948 细节 蛋白酶体激活复合物亚基1 Q06323 细节 蛋白质二硫异构酶A3 P30101 细节 蛋白质S100-A9 P06702 细节 原肌凝蛋白-3链 P06753 细节 原肌凝蛋白-4链 P67936 细节 角蛋白,I型细胞骨架10 P13645 细节 角蛋白,I型细胞骨架16 P08779 细节