黑素体生物成因及功能的蛋白质组学及生物信息学特征。

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Chi A, Valencia JC, Hu ZZ, Watabe H, Yamaguchi H, Mangini NJ, Huang H, Canfield VA, Cheng KC, Yang F, Abe R, Yamagishi S, Shabanowitz J, Hearing VJ, Wu C, apella E, Hunt DF

黑素体生物成因及功能的蛋白质组学及生物信息学特征。

蛋白质组学杂志2006年11月;5(11):3135-44。

PubMed ID

17081065 (PubMed视图

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摘要

黑色素是人类几乎所有可见的皮肤、头发和眼睛色素沉着的原因，它是在称为黑素体的亚细胞细胞器中合成、沉积和分布的。对这种细胞器的蛋白质组成的全面测定被存在的黑色素所阻碍。在这里，我们报告了一种去除黑色素的新方法，包括溶液消化和固定金属亲和层析(IMAC)。与凝胶消解一起，这种方法使我们能够通过串联质谱来描述不同发育阶段的黑素体蛋白质组。对黑素体蛋白质组的比较分析和功能表征在所有阶段的黑素体中确定了大约1500种蛋白质，在任何给定阶段大约有600种蛋白质。这些蛋白质包括16个与小鼠皮毛颜色同源的基因，许多与人类色素疾病相关。来自着色和非着色黑素细胞的黑素小体共享的大约100种蛋白质定义了必需的黑素小体蛋白质组。通过确认其细胞内定位而验证的蛋白质包括PEDF(色素上皮衍生因子)和SLC24A5(钠/钾/钙交换器5,NCKX5)。黑素小体和其他溶酶体相关细胞器之间的蛋白质共享表明了共同的进化起源。这项工作为溶酶体相关细胞器的生物发生研究提供了一个模型。

引用本文的药物库数据

多肽

的名字	UniProt ID
中性氨基酸转运蛋白B(0)	Q15758	细节
酪氨酸酶	P14679	细节
Gamma-glutamyl水解酶	Q92820	细节
中性氨基酸转运蛋白A	P43007	细节
钠钾转运atp酶亚基α -1	P05023	细节
组织蛋白酶B	P07858	细节
组织蛋白酶D	P07339	细节
脂肪酸合成酶	P49327	细节
Calnexin	P27824	细节
溶质载体家族2，葡萄糖转运体成员1	P11166	细节
78 kDa葡萄糖调节蛋白	P11021	细节
ras相关C3肉毒毒素底物	P63000	细节
热休克蛋白hsp90 - α	P07900	细节
Endoplasmin	P14625	细节
膜联蛋白A2	P07355	细节
14-3-3蛋白质zeta/delta	P63104	细节
Adenosylhomocysteinase	P23526	细节
热休克蛋白hsp90 - β	P08238	细节
肽酰脯氨酸顺反异构酶B	P23284	细节
蛋白质disulfide-isomerase	P07237	细节
跨膜糖蛋白NMB	Q14956	细节
整合素beta 1	P05556	细节
矩阵metalloproteinase-14	P50281	细节
热休克同源蛋白71 kDa	P11142	细节
v型质子atp酶亚基B，脑亚型	P21281	细节
ras相关蛋白rab7a	P51149	细节
Myosin-11	P35749	细节
ras相关蛋白rabb - 5a	P20339	细节
gtp结合核蛋白Ran	P62826	细节
14-3-3蛋白质	P62258	细节
中性-葡萄糖苷酶AB	Q14697	细节
转铁蛋白受体蛋白1	P02786	细节
钠/钾运输atp酶亚单位β -3	P54709	细节
Peroxiredoxin-1	Q06830	细节
14-3-3蛋白β / α	P31946	细节
蛋白质二硫异构酶A3	P30101	细节
色素上皮衍生因子	P36955	细节
瞬态受体电位阳离子通道亚家族V成员2	Q9Y5S1	细节
v型质子atp酶116 kDa亚基a亚型1	Q93050	细节
v型质子atp酶亚基g2	O95670	细节
黑色素细胞蛋白PMEL	P40967	细节