大肠杆菌基因组分析。五、76.0 - 81.5分钟区域DNA序列。

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引用

Sofia HJ, Burland V, Daniels DL, Plunkett G 3rd, Blattner FR

大肠杆菌基因组分析。五、76.0 - 81.5分钟区域DNA序列。

核酸决议1994年7月11日;22(13):2576-86。

PubMed ID
8041620 (在PubMed
摘要

这里描述了大肠埃希菌K-12基因组225.4千碱基片段的DNA序列,在遗传图谱上从76.0分钟到81.5分钟。这使得大肠杆菌基因组计划的连续序列总数达到725.1 kb(76.0到92.8分钟)。我们发现了191个假定编码基因(orf),其中72个基因是已知的,110个基因在文献和相似性搜索中仍未确定。必威国际app7个新基因——arsE, arsF, arsG, treF, xylR, xylG,和xylH——以及之前定位的pit和dctA基因被识别出来。建议的基因排列相对于可能的启动子和终止子提示90个潜在的转录单位。其他特征包括19个REP元素,95个计算机预测的弯曲,50个Chi位点和一个灰洞。发现31个假定的信号肽,包括13个已知的膜或质周蛋白。一个tRNA基因(proK)和两个插入序列(IS5和IS150)位于这个片段中。这一区域的基因以相同数量的复制定向或反复制定向排列。

引用本文的药库数据

多肽
的名字 UniProt ID
谷胱甘肽还原酶 P06715 细节
2, 3-diketo-L-gulonate还原酶 P37672 细节
ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase P67910 细节
DNA-3-methyladenine糖基化酶1 P05100 细节
2-氨基-3-酮丁酸辅酶A连接酶 P0AB77 细节
谷氨酸脱羧酶α P69908 细节
Nickel-binding周质蛋白 P33590 细节
冷休克蛋白CspA P0A9X9 细节