AGXT基因的选择性外显子测序为50%的原发性高草酸尿1型患者提供了遗传诊断。
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引用
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威廉姆斯E,拉姆斯比G
AGXT基因的选择性外显子测序为50%的原发性高草酸尿1型患者提供了遗传诊断。
临床化学。2007七月;53(7):1216-21。Epub 2007 5月10日。
- PubMed ID
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17495019 (PubMed视图]
- 摘要
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背景:原发性高草酸尿症1型(PH1)的明确诊断需要分析肝脏中的丙氨酸:乙醛酸转氨酶(AGT)活性。我们之前的研究表明,针对AGXT基因中3个最常见的突变(C . 33_34insc, C . 508g >A和C . 731t >C)的靶向筛查可以为34.5%的PH1患者提供分子诊断,无需进行肝活检。在回顾了所有AGXT突变的分布后,我们评估了一种使用选择性外显子测序进行PH1分子诊断的诊断策略。方法:我们对300例活检证实的PH1患者的外显子1、4和7进行测序,并在体外表达所识别的错义突变。结果:我们在224例患者(75%)中鉴定出至少1个突变,在149例患者中鉴定出2个突变,诊断敏感性提高到50%。我们检测到29种序列变化,其中15种是新的。其中4个突变位于外显子1 (C . 2_3delinsat, C . 30_32delcc, C . 122g >A, C . 126delg), 7个突变位于外显子4 (C . 447_454delgctgctgt, C . 449t >C, C . 473c >T, C . 481g >A, C . 481g >T, C . 497t >C, C .424- 2a >G), 4个突变位于外显子7 (C . 725inst, C . 737g >A, C . 757t >C, C .776 + 1G>A)。在体外表达时,错误意义的改变与AGT催化活性的严重降低和阴性免疫反应有关。错义突变c.26C>A,先前被描述为病理性突变,具有与野生型酶相似的活性。结论:选择性外显子测序可以明确诊断50%的PH1患者。 The test offers a rapid turnaround time (15 days) with minimal risk to the patient. Demonstration of the expression of missense changes is essential to demonstrate pathogenicity.