人碳酸酐酶小分子抢救中结合位点的定位。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
Bhatt D, Fisher SZ, Tu C, McKenna R, Silverman DN
人碳酸酐酶小分子抢救中结合位点的定位。
生物工程学报，2007年1月15日;32(2):562-70。Epub 2006年10月27日。
- PubMed ID
-
17071654 (PubMed视图]
- 摘要
-
人碳酸酐酶II (HCA II)突变形式的小分子拯救是通过外源性给体/受体参与锌结合水和溶液之间的质子转移途径发生的。为了更彻底地研究这种激活的能量学，我们构建了一个突变体H64W HCA II，我们已经证明它被4-甲基咪唑(4-MI)激活，其机制涉及4-MI与锌中Trp-64的侧链结合约8 a。一系列实验与咪唑和吡啶衍生物作为外源质子供体与Trp-64吲哚环相互作用激活H64W HCA II相一致;这些实验包括与质子转移一致的pH曲线和H/D溶剂同位素效应，与Gly-64相比，含有Trp-64的突变体的活化大约是Gly-64的四倍，以及通过x射线晶体学观察到w4a - h64w HCA II中与Trp-64吲哚侧链相关的4-MI的结合。结合在W5A-H64W HCA II中较不灵活的Trp-64侧链上的质子供体没有显示激活，但结合在H64W HCA II中较灵活的Trp-64侧链上的质子供体显示激活，这支持了结合位点的构象迁移与更有效的质子转移有关的观点。用Marcus理论评价表明，这些质子供体对H64W HCA II的活化反映在功函数w(r)和w(p)上，而不是反映在本征Marcus势垒本身，这与溶剂重组在催化中的作用一致。