识别小说在秀丽隐杆线虫人类基因的进化的比较蛋白质组学。

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赖CH,周CY, CH引入LY,刘CS,林W

识别小说在秀丽隐杆线虫人类基因的进化的比较蛋白质组学。

基因组研究》2000;10 (5):703 - 13。

PubMed ID

10810093 (在PubMed

]

文摘

现代生物医学研究极大地受益于大规模测序项必威国际app目从研究的病毒,细菌和酵母多细胞生物,如线虫。前景比较基因组研究提供大量的人类直接同源基因的鉴定和功能注释。我们提出了一种新颖的比较蛋白质组学的方法对人类基因重叠群装配和协助基因的发现。秀丽隐杆线虫蛋白质组是用作小说对齐模板来协助人类基因识别从人类EST核苷酸数据库。可用18452秀丽隐杆线虫蛋白质序列中,我们的研究结果表明,至少83%(15344序列)的秀丽隐杆线虫蛋白质组有人类同源基因,包含7954条记录的秀丽隐杆线虫匹配已知的人类基因转录的蛋白质。只有11%或更少的秀丽隐杆线虫蛋白质组包含nematode-specific基因。我们发现剩余的7390序列可能导致发现的人类基因,和超过150个假定的完整的人类基因转录是组装在进一步分析数据库。(本文中描述的序列数据已经提交

DrugBank数据引用了这篇文章

多肽

的名字	UniProt ID
酪氨酸- tRNA连接酶、线粒体	Q9Y2Z4	细节
Methionine-R-sulfoxide还原酶B2,线粒体	Q9Y3D2	细节
白氨酸羧基甲基转移酶1	Q9UIC8	细节
NADH脱氢酶(辅酶q) 1α复形单元13	Q9P0J0	细节
Glutaredoxin-2,线粒体	Q9NS18	细节
视黄醇脱氢酶11	Q8TC12	细节
γ分泌酶亚基APH-1A	Q96BI3	细节
60年代核糖体亚基生物起源蛋白质NIP7同系物	Q9Y221	细节
贩卖蛋白质粒子复杂的亚基4	Q9Y296	细节
Diphthine甲基酯合成酶	Q9H2P9	细节
RuvB-like 2	Q9Y230	细节
锌转运体ZIP1	Q9NY26	细节
伸长的长链脂肪酸蛋白质1	Q9BW60	细节
v型质子atp酶亚基H	Q9UI12	细节