晶体结构的鸟氨酸转氨酶非常具体和有效的抑制剂5-fluoromethylornithine复合体。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
Storici P,两位G,穆勒R, Schirmer T, Jansonius约
晶体结构的鸟氨酸转氨酶非常具体和有效的抑制剂5-fluoromethylornithine复合体。
J杂志。1999年1月8日,285 (1):297 - 309。
- PubMed ID
-
9878407 (在PubMed]
- 文摘
-
鸟氨酸转氨酶(l-ornithine: 2-oxoacid delta-aminotransferase;EC 2.6.1.13) pyridoxal-5”-phosphate-dependent控制l-ornithine水平组织的线粒体酶的催化转移delta-amino群l-ornithine 2-oxoglutarate,生产l-glutamate——gamma-semialdehyde和l-glutamate。(2 s, 5 s) 5-fluoromethylornithine是唯一为鸟氨酸转氨酶已知抑制剂只特定的日期。在体外和体内,它阻碍了酶的自杀反应导致共价与代数余子式的加合物。酶抑制剂复合物的晶体结构是解决1.95的一项决议。没有明显的构象变化与原生酶结构观察。揭示了原子结构的细节cofactor-inhibitor加合物与酶的活性部位及其交互。主要残留Arg180负责特定绑定的抑制剂,形成一个强大的盐桥与alpha-carboxylate Tyr55,参与一个简短的氢键的alpha-amino组。外消旋混合物的实验观察,(2 s, 5 s) 5-fluoromethylornithine是专门负责酶抑制可以解释的基础上积极网站拓扑结构。模型建立的研究有力地表明,自然衬底l-ornithine,在其外部醛亚胺加合物的酶,利用相同的识别网站的抑制剂。 It is proposed that the neutralization of the active site Arg413 by a salt bridge with Glu235 also plays an important role in productive binding of both 5-fluoromethylornithine and l-ornithine. Arg180 and Arg413 are believed to be instrumental in recognition of l-glutamate, by binding its gamma and alpha-carboxylate groups, respectively. This requires a different side-chain conformation of Glu235. Lys292 is the only obvious candidate for catalyzing the rate-limiting proton transfer steps in the transamination reaction.