gene-dense疼痛/ TFR2地区的比较分析对人类染色体的同源区域7的时候鼠标染色体5。
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威尔逊博士Riemer C,马丁代尔DW, Schnupf P, Boright美联社,张TL,哈迪DM,施瓦茨年代,谢勒西南,徐LC,米勒W, Koop男朋友
gene-dense疼痛/ TFR2地区的比较分析对人类染色体的同源区域7的时候鼠标染色体5。
核酸研究》2001年3月15日,29 (6):1352 - 65。
- PubMed ID
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11239002 (在PubMed]
- 文摘
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7号染色体的时候一直是许多细胞遗传学和分子研究的重点旨在描述区域通常删除髓系白血病和骨髓增生异常综合征。我们有一个gene-dense相比,GC-rich次区域的7的时候鼠标5号染色体同源区域。640 kb的基因组DNA的物理图谱鼠标5号染色体是来源于一系列重叠的细菌人工染色体。296 kb段的物理图谱,包括疼痛:Tfr2,相比之下,267 kb的人类的序列。我们确定了守恒的连杆的12个基因包括一个开放阅读框两侧疼痛:Asr2,小说cation-chloride转运蛋白相互作用蛋白Cip1, Ephb4、Zan Perq1。这些基因已经被先前的描述,在每种情况下我们现在的新数据来源于比较序列分析。相邻的未完成的序列数据鼠标包含一个同源的10块额外的基因包括三位小说cDNA序列,我们随后映射到人类7的时候。显示比较基因组信息的方法,包括未完成的序列数据,正变得越来越重要。我们与一个新的补充我们打印的比较分析,基于web的项目叫做Laj(局部比对与java)。Laj提供交互式访问存档两两序列比对通过WWW。 It displays synchronized views of a dot-plot, a percent identity plot, a nucleotide-level local alignment and a variety of relevant annotations. Our mouse-human comparison can be viewed at http://web.uvic.ca/~bioweb/laj.html. Laj is available at http://bio.cse.psu.edu/, along with online documentation and additional examples of annotated genomic regions.