胆碱酯酶的内部和外部静电势模型。
文章的细节
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引用
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镶嵌地块CE、Botti SA Lifson年代,Silman我,苏斯曼杰
胆碱酯酶的内部和外部静电势模型。
J摩尔图模型。1997年10月,15(5):318 - 27日335 - 7。
- PubMed ID
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9640563 (在PubMed]
- 文摘
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静电势不同物种的胆碱酯酶的三维结构计算,使用Delphi算法,Poisson-Boltzmann方程的基础上。我们使用结构鱼雷californica和鼠标乙酰胆碱酯酶,并建造人类的同源性模型,Bungarus fasciatus,人类butyrylcholinesterase和黑腹果蝇乙酰胆碱酯酶。所有这些结构揭示了负面的外部表面的潜力,在该地区在活性位点峡谷入口,变得更加消极的rim峡谷是接近。此外,在所有情况下,潜在的变得越来越消极沿中心轴运行峡谷,最大的峡谷底部,在活性部位附近。十大重点酸性残留保存在疼痛来自不同物种的序列比对,在表面活性位点峡谷的入口处附近地区和基地,主要负责这些潜力。势是高度相关的结构检查,序列的身份低至35%。这意味着他们是守恒的胆碱酯酶家族的财产,可以用来吸引带正电的底物进入峡谷到活动现场,和对胆碱酯酶可以扮演其他角色重要功能。