全基因组关联研究确定的遗传变异在GOT1确定血清天冬氨酸转氨酶水平。
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老沈H, Damcott C, Shuldiner,柴年代,杨R,胡锦涛H,吉布森Q,瑞安KA,米切尔BD,龚DW
全基因组关联研究确定的遗传变异在GOT1确定血清天冬氨酸转氨酶水平。
J哼麝猫。2011年11月,56 (11):801 - 5。doi: 10.1038 / jhg.2011.105。Epub 2011年9月8日。
- PubMed ID
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21900944 (在PubMed]
- 文摘
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我们进行了全基因组关联研究血清天冬氨酸转氨酶(AST)活性在866年阿米什参与者的遗传和表型干预心脏研究和确定重大AST协会活动集群的单核苷酸多态性位于染色体10 q24.1(峰值协会rs17109512;P = 2.80 e-14),附近的GOT1,基因编码胞质AST (cAST)。测序GOT1透露在坐标系的删除三个核酸编码天冬酰胺在389 c的位置。1165年_1167delaac (p.Asn389del)基因。删除航空公司显著降低该AST活动水平而常见的等位基因(均值+ /南达科他州。:10.0 + / - -2.8和18.8 + / - -5.2 U l (1);P = 2.80 e-14)。进一步的pcr删除其他阿米什样本(n = 1932)发现了一个额外的20运营商(小等位基因频率(加)= 0.0052)。删除没有检测到647年远白种人。Asn已知的哺乳动物投389密码子是守恒的。体外瞬时转染野生型和突变体表明突变难以觉察的蛋白质在细胞。此外,即使修正表达式,突变体有明显减弱酶活性。 Remarkably, we did not find any association between the deletion and metabolic traits including serum fasting glucose or insulin, fasting and post-meal lipids, inflammatory markers, or sub-clinical markers of cardiovascular disease. In conclusion, we discovered a rare in-frame deletion in GOT1 gene, which inactivates cAST enzyme in the Old Order Amish. This finding will help us to understand structure and function of the enzyme and would be useful for predicting serum AST levels.