结构之间的相互作用的基础人力谷氨酸二羧肽酶及其底物类似物。
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Barinka C, Hlouchova K, Rovenska M, maj P,爱抚,欣N, Ko y,冢本T,碎浆机BS,间J, Lubkowski J
结构之间的相互作用的基础人力谷氨酸二羧肽酶及其底物类似物。
J杂志。2008年3月7日,376 (5):1438 - 50。doi: 10.1016 / j.jmb.2007.12.066。2008年1月5 Epub。
- PubMed ID
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18234225 (在PubMed]
- 文摘
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人类谷氨酸羧肽酶II (GCPII)参与神经元信号转导和肠道吸收叶酸通过水解的两个自然基质,分别N-acetyl-aspartyl-glutamate和folyl-poly-gamma-glutamates。在过去的几年中,巨大的努力已经向GCPII的结构分析。GCPII晶体结构的复杂与不同的配体提供了洞察这些配体的结合,特别是酶的S1 '网站。在本文中,我们扩展结构表征GCPII S1网站通过使用dipeptide-based抑制剂与S1和S1 '网站的酶。为此,我们已经确定晶体结构复杂的人类GCPII phosphapeptide folyl-gamma-glutamate的对应物,aspartyl-glutamate, gamma-glutamyl-glutamate,精制为1.50,1.60,和1.67一项决议。的S1口袋GCPII可以准确地定义和分析第一次和数据显示Asn519的重要性,Arg463, Arg534, Arg536识别倒数第二(即。P1)底物残留。带正电的胍盐组之间的直接交互Arg534 Arg536和衬底的P1一半/抑制剂提供机械的解释GCPII偏好酸性二肽。此外,观察到的构象的灵活性Arg463和Arg536侧链可能向不同的抑制剂和调节调节GCPII亲和力GCPII底物特异性。生化实验评估几个GCPII底物的水解衍生工具修改P1的位置,也包含在这个报告,进一步补充和扩展的结论源自于结构分析。这里描述的数据形成一个坚实的基础的结构辅助设计新颖的低分子量GCPII抑制剂和显像剂。