信号序列和关键字在网上陷阱选择完整的人类的互补编码或膜蛋白分泌oligo-capped cDNA库。

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哈亚希的大月T, Ota T T, K,铃木Y,山本J,若松,木村K, Sakamoto K,波多野N,卡瓦依Y, Ishii年代,齐藤K,小岛,Sugiyama T, T,小野冈K, Yoshikawa Y, Aotsuka年代,佐佐木N,服部年宏,时候K, Nagai K, Sugano年代,Isogai T

信号序列和关键字在网上陷阱选择完整的人类的互补编码或膜蛋白分泌oligo-capped cDNA库。

DNA研究》2005;12(2):117 - 26所示。

PubMed ID

16303743 (在PubMed

]

文摘

我们已经开发了一个在硅片的方法选择人类的全长cDNA编码或膜蛋白分泌oligo-capped cDNA库。丰满的结合率增加到80%左右oligo-capping方法和ATGpr,软件翻译起始点预测和编码的潜力。然后,使用5 '端单次的序列,互补的信号序列被PSORT选择(“信号序列陷阱”)。我们还应用“分泌或膜相关蛋白质关键字陷阱”基于爆炸针对SWISS-PROT数据库搜索的结果不能由PSORT的互补。必威国际app使用上述程序,789的互补主要是选择和受到完整的排序,和334个互补终于选为小说。大部分的互补(295的互补:88.3%)预测编码分泌或膜蛋白。尤其是,165年(80.5%)的205年的互补选择PSORT预测信号序列,而70年(54.2%)的129年的互补选择“关键词陷阱”保存分泌或膜相关蛋白质的关键词。取得了许多重要的互补,包括转运蛋白、受体、配体,参与重要的细胞功能。因此,一个有效的方法选择分泌或膜蛋白互补脱氧核糖核酸是由结合上面的四个过程。

DrugBank数据引用了这篇文章

多肽

的名字	UniProt ID
视黄醇脱氢酶13	Q8NBN7	细节
组织蛋白酶B	P07858	细节
突触囊泡糖蛋白2 a	Q7L0J3	细节
Corticoliberin	P06850	细节
5 '核苷酸酶	P21589	细节
微管蛋白beta-4A链	P04350	细节
ADP-ribose焦磷酸酶,线粒体	Q9BW91	细节
Syndecan-2	P34741	细节
胆碱transporter-like蛋白2	Q8IWA5	细节
Prolyl 3-hydroxylase 1	Q32P28	细节
脂肪酸desaturase 2	O95864	细节
琥珀酸脱氢酶(辅酶q)细胞色素b小亚基,线粒体	O14521	细节
线粒体dicarboxylate载体	Q9UBX3	细节
硫氧还蛋白domain-containing蛋白质12	O95881	细节
14-reductase All-trans-retinol 13日	Q6NUM9	细节
视黄醇脱氢酶11	Q8TC12	细节
雌二醇17-beta-dehydrogenase 11	Q8NBQ5	细节
跨膜转换前后蛋白质1同族体	Q6NXT6	细节
Pannexin-1	Q96RD7	细节
NADH-cytochrome b5还原酶1	Q9UHQ9	细节
羧肽酶问	Q9Y646	细节
细胞色素P450 4 f12	Q9HCS2	细节
溶质载体家庭2,促进葡萄糖转运体成员6	Q9UGQ3	细节
溶质载体家庭2,促进葡萄糖转运体成员11	Q9BYW1	细节
伸长的长链脂肪酸蛋白5	Q9NYP7	细节
43溶质载体家庭成员3	Q8NBI5	细节
Sodium-coupled中性氨基酸转运体1	Q9H2H9	细节
Prostaglandin-H2 D-isomerase	P41222	细节
锌转运体ZIP1	Q9NY26	细节
v型质子atp酶亚基S1	Q15904	细节
UbiA prenyltransferase domain-containing蛋白质1	Q9Y5Z9	细节
小鼠抗原	Q5ZPR3	细节